More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4092 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4092  adenosylhomocysteinase  100 
 
 		 394 aa  812    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.813316  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_1357  adenosylhomocysteinase  38.57 
 
 		 380 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.361298  normal  0.0210902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2821  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417356  normal  1 
 
 
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NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  37 
 
 		 548 aa  176  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4847  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.39 
 
 		 90 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281784  normal  0.138792 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  32.97 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase, NAD binding  31.28 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  30.6 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
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NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.17 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.47 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.34 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.29 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  27.44 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.98 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.27 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.14 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
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NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.95 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.44 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
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CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  30 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0872  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.53 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.69 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3758  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.57 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3043  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.42 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365932  n/a   
 
 
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NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.07 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.1 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
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NC_009511  Swit_2674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_34780  S-adenosylhomocysteine hydrolase  32.11 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0841132  normal  1 
 
 
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NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.4 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  25.96 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.17 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.012931  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.57 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.57 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.41 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.57 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
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NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  33 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.41 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  27.37 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.68 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  32.58 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.2 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
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NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.77 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.57 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.68 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.17 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.12 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  30.33 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.02 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.56 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.95 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.78 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500426 
 
 
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NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  26.35 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.38 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.62 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.65 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_0469  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.410988  normal  1 
 
 
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NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  27 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.49 
 
 		 477 aa  76.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_03570  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.24 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0760213  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  24.53 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_4683  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.37 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.85 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
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NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.17 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.87 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  28.08 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
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NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.52 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.67 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  28.57 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.206287 
 
 
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NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.07 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.39 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.78 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.41 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.39 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.78 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.55 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  25.87 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
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NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.6 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  27.13 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
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BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  28.02 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
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NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.88 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.88 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.88 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.88 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  25.88 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
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NC_013422  Hneap_0414  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  24.2 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.88 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.88 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.88 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.88 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  30.45 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_5280  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.2 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.6 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_4849  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697439 
 
 
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NC_010322  PputGB1_5025  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.59 
 
 		 465 aa  72.8  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.23 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
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NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  28.24 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
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NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  27.14 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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