More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0872 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0872  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
500 aa  1027    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.56 
 
 
404 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.37 
 
 
404 aa  240  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.48 
 
 
417 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.69 
 
 
399 aa  236  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.95 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8789  Adenosylhomocysteinase  41.98 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.88 
 
 
401 aa  234  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.37 
 
 
421 aa  233  9e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  34.97 
 
 
414 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  34.28 
 
 
415 aa  227  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.01 
 
 
418 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.34 
 
 
437 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.02 
 
 
415 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  35.9 
 
 
415 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.93 
 
 
415 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.636373 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  34.89 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  34.37 
 
 
426 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  35.31 
 
 
408 aa  221  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.12 
 
 
428 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  35.55 
 
 
425 aa  217  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  36.04 
 
 
439 aa  217  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.92 
 
 
408 aa  216  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  36.29 
 
 
425 aa  216  9e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  36.01 
 
 
416 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.6 
 
 
417 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  36.48 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  33.84 
 
 
403 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  37.21 
 
 
408 aa  213  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  35.2 
 
 
420 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.53 
 
 
436 aa  211  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  34.79 
 
 
420 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  33.68 
 
 
417 aa  210  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  36.32 
 
 
417 aa  210  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  35.05 
 
 
414 aa  209  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  36.77 
 
 
411 aa  209  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  36.68 
 
 
417 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  34.28 
 
 
418 aa  207  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  34.36 
 
 
413 aa  206  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.47 
 
 
429 aa  206  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.53 
 
 
410 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  36.06 
 
 
421 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.05 
 
 
411 aa  203  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  35.38 
 
 
413 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.13 
 
 
442 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  32.9 
 
 
422 aa  199  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.89 
 
 
420 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  34.08 
 
 
429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.25 
 
 
408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.05 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.73 
 
 
436 aa  196  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.73 
 
 
437 aa  196  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  34.34 
 
 
420 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  32.01 
 
 
430 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.63 
 
 
418 aa  194  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  33.59 
 
 
414 aa  192  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  31.69 
 
 
418 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.54 
 
 
418 aa  192  9e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  33.84 
 
 
418 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.25 
 
 
408 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.83 
 
 
420 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  34.08 
 
 
422 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  34 
 
 
419 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  32.13 
 
 
426 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.19 
 
 
420 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.92 
 
 
416 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.53 
 
 
425 aa  190  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  34.11 
 
 
419 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  35.73 
 
 
421 aa  190  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.14 
 
 
418 aa  189  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  33.25 
 
 
425 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.81 
 
 
425 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.46 
 
 
428 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  34.52 
 
 
427 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  32.66 
 
 
438 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  31.96 
 
 
438 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.93 
 
 
431 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.08 
 
 
434 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.43 
 
 
437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  32.31 
 
 
421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.39 
 
 
441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  31.03 
 
 
413 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.33 
 
 
429 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.87 
 
 
425 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.63 
 
 
425 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.9 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  35.83 
 
 
422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  32.98 
 
 
418 aa  180  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.02 
 
 
425 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.3 
 
 
438 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  32.95 
 
 
406 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.34 
 
 
426 aa  177  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.27 
 
 
435 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.68 
 
 
425 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  34.11 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.06 
 
 
480 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.59 
 
 
469 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  30.98 
 
 
419 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.06 
 
 
480 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.32 
 
 
480 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>