More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2401 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
163 aa  327  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
146 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  54.97 
 
 
147 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  54.97 
 
 
147 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  52 
 
 
156 aa  153  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  50.66 
 
 
148 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  50.66 
 
 
148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  48.05 
 
 
155 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  49.04 
 
 
180 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  49.66 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  48.67 
 
 
173 aa  143  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  45.16 
 
 
155 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  45.12 
 
 
164 aa  138  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  46 
 
 
154 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  42.41 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  39.76 
 
 
166 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  41.14 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  35.03 
 
 
218 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  37.09 
 
 
148 aa  97.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.77 
 
 
147 aa  97.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 
150 aa  89  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  29.55 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
164 aa  87  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  39.16 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  36.91 
 
 
163 aa  85.1  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  43 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
147 aa  84.7  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
169 aa  84.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
145 aa  84  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
172 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
144 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  33.33 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  32.77 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  40.3 
 
 
191 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  37.19 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
146 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
146 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  29.33 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  31.17 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  30.65 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  29.84 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  36.51 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  36.51 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  40.22 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  28.36 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  29.53 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  34.41 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  37.86 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.45 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  31.45 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>