More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1265 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1067  hypothetical protein  65.61 
 
 
225 aa  307  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  63.8 
 
 
227 aa  296  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  61.99 
 
 
225 aa  294  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4814  TrkA-N domain protein  57.46 
 
 
226 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3449  TrkA-N domain protein  63.35 
 
 
230 aa  271  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2667  TrkA-N domain protein  63.35 
 
 
230 aa  271  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  29.78 
 
 
220 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0087  potassium transporter peripheral membrane component  27.65 
 
 
466 aa  89.4  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  27.65 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  31.02 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  27.03 
 
 
443 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 
452 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 
221 aa  85.1  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  28.32 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  25.74 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  26.19 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  25.74 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  26.19 
 
 
221 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  24.38 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  30.09 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  28.76 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  27.43 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  25.71 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  27.83 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  23.53 
 
 
450 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  25.71 
 
 
221 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  25.47 
 
 
222 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  23.77 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 
465 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  25.93 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  24.3 
 
 
449 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  26.85 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  26.96 
 
 
445 aa  76.3  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  22.5 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  26.96 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  24.24 
 
 
444 aa  75.5  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 
445 aa  75.1  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  23.11 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  23.9 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  24.75 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  28.82 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  25.73 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  22.54 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  26.05 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  26.61 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  25.44 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  24.27 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  25 
 
 
445 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  23.03 
 
 
221 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  27.81 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  26.19 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 
620 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  39.39 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  39.22 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  26.18 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  26.73 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.33 
 
 
457 aa  68.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 
458 aa  68.6  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  26.73 
 
 
617 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  22.42 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  23.68 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  25 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  23.68 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  23.68 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 
458 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  24.45 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  22.62 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  40.4 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  26.34 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  38.38 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  41.35 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  39.39 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  23.89 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  23.89 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  25.88 
 
 
477 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  23.89 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  23.45 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  27.14 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  23.89 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  26.79 
 
 
443 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  27.71 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  34.45 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  27.23 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  25.11 
 
 
449 aa  65.5  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  37.29 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  24.3 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  22.71 
 
 
458 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  22.71 
 
 
458 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  23.58 
 
 
458 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  26.52 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>