More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0858 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  100 
 
 
1406 aa  2839    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0715  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  41.8 
 
 
1313 aa  992    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0403272  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  64.42 
 
 
879 aa  878    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  32.01 
 
 
1781 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  32.01 
 
 
1781 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  46.52 
 
 
1153 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  46.52 
 
 
1153 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  34.33 
 
 
1100 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  45.13 
 
 
902 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
937 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  43.66 
 
 
1142 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  43.66 
 
 
1142 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 
1285 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
1072 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.78 
 
 
778 aa  370  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
1036 aa  349  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
1319 aa  347  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1716  putative PAS/PAC sensor protein  26.58 
 
 
1099 aa  347  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0061  chemotaxis sensory transducer  59.12 
 
 
752 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.691552  normal  0.30416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.45 
 
 
750 aa  325  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
852 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  31.25 
 
 
934 aa  307  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.3 
 
 
820 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.72 
 
 
503 aa  300  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  49.42 
 
 
982 aa  298  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.81 
 
 
839 aa  296  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.83 
 
 
915 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.27 
 
 
975 aa  288  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0720  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.86 
 
 
880 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.86 
 
 
880 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
928 aa  275  7e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 
768 aa  264  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
787 aa  254  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.68627  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.95 
 
 
1105 aa  254  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610597  normal  0.482443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 
854 aa  244  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 
854 aa  244  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
560 aa  223  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
732 aa  223  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.29 
 
 
543 aa  218  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403133  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3896  chemotaxis sensory transducer  37.96 
 
 
706 aa  214  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.29 
 
 
473 aa  212  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 
700 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 
691 aa  209  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1815  putative chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 
475 aa  209  4e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 
686 aa  208  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 
686 aa  207  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.688228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.09 
 
 
745 aa  206  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.484204  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 
759 aa  206  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
1560 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
745 aa  205  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
745 aa  205  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 
704 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.02239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 
686 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0070905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2549  chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 
707 aa  202  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 
686 aa  202  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468878  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  36.1 
 
 
743 aa  201  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 
678 aa  201  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 
686 aa  201  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  36.84 
 
 
682 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 
686 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  36.84 
 
 
682 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3631  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.87 
 
 
731 aa  199  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.455048  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 
575 aa  199  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 
777 aa  198  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0103685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0128  chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
537 aa  197  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01605  pilus biogenesis protein  37.39 
 
 
678 aa  196  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 
770 aa  196  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  38.2 
 
 
680 aa  196  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 
754 aa  195  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0204496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 
754 aa  195  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946853  normal  0.162427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5031  type IV pilus biogenesis protein PilJ  38.51 
 
 
680 aa  195  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 
749 aa  195  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.89 
 
 
733 aa  193  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 
692 aa  193  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.534971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 
733 aa  193  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 
745 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 
767 aa  192  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3351  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 
759 aa  191  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0517  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 
671 aa  190  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
1183 aa  190  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 
628 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1019  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.97 
 
 
680 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58121  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 
680 aa  186  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 
678 aa  184  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.89 
 
 
626 aa  171  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 
601 aa  170  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.89 
 
 
636 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 
571 aa  166  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  35.15 
 
 
549 aa  164  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 
673 aa  159  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
1977 aa  159  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
1021 aa  159  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  34.92 
 
 
533 aa  158  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
539 aa  157  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 
658 aa  157  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  32.17 
 
 
658 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 
807 aa  156  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 
570 aa  155  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 
540 aa  155  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 
550 aa  155  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>