283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0660 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  100 
 
 
323 aa  655    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  53.64 
 
 
278 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  53.26 
 
 
278 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  52.9 
 
 
278 aa  276  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  50.76 
 
 
284 aa  272  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  54.79 
 
 
281 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  50.78 
 
 
289 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  47.17 
 
 
283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  48.38 
 
 
308 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  47.66 
 
 
314 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  46.3 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  40.86 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  40.23 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  34.38 
 
 
279 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  39.84 
 
 
291 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  34.38 
 
 
279 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  33.59 
 
 
279 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  33.2 
 
 
279 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  39.39 
 
 
375 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  37.19 
 
 
288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  34.52 
 
 
286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  36.93 
 
 
293 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.98 
 
 
293 aa  159  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.98 
 
 
293 aa  159  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  34.28 
 
 
286 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  34.28 
 
 
286 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  34.39 
 
 
290 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  32.12 
 
 
270 aa  155  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  42.26 
 
 
360 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  34.52 
 
 
286 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  38.08 
 
 
370 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 
288 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  37.14 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  37.14 
 
 
367 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  32.39 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  37.85 
 
 
364 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.82 
 
 
307 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
287 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  34.71 
 
 
313 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  37.25 
 
 
360 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  34.52 
 
 
307 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  32.99 
 
 
334 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.57 
 
 
746 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.68 
 
 
735 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  32.27 
 
 
288 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  34.15 
 
 
286 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  32.62 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  35.05 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.18 
 
 
308 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.33 
 
 
746 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  32.51 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.33 
 
 
746 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.38 
 
 
311 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  32.52 
 
 
291 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  33.22 
 
 
534 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  33.57 
 
 
368 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.1 
 
 
298 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 
280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.53 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
309 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.86 
 
 
746 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  34.36 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  32.74 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  31.79 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  30 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  35.17 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  29.68 
 
 
290 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.11 
 
 
311 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  31.54 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  28.17 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  32.51 
 
 
535 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  30.58 
 
 
328 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.68 
 
 
750 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  35.07 
 
 
373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  34.05 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.82 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.16 
 
 
746 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  34.83 
 
 
329 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  34.83 
 
 
329 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  30.24 
 
 
328 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  29.14 
 
 
284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 
364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.12 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  29.47 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.11 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.75 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.58 
 
 
746 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  34.84 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.63 
 
 
752 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 
367 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  29.33 
 
 
292 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  31.52 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  36.55 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.45 
 
 
746 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  29.39 
 
 
369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>