More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0640 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  65.16 
 
 		 590 aa  735    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  61.59 
 
 		 583 aa  734    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  61.64 
 
 		 607 aa  727    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  100 
 
 		 588 aa  1164    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  64.01 
 
 		 581 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  61.65 
 
 		 574 aa  715    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  61.47 
 
 		 574 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  61.1 
 
 		 584 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  52.43 
 
 		 600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  50.86 
 
 		 598 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15751  multidrug ABC transporter  51.31 
 
 		 583 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  48.87 
 
 		 581 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09061  multidrug ABC transporter  47.73 
 
 		 581 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06901  multidrug ABC transporter  47.92 
 
 		 583 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.780793  normal  0.494245 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  47.92 
 
 		 583 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  48.09 
 
 		 583 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09041  multidrug ABC transporter  48.6 
 
 		 581 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  47.55 
 
 		 581 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 650 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 		 591 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  37.52 
 
 		 611 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  35.78 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.69 
 
 		 610 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  37.22 
 
 		 582 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 569 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  37.39 
 
 		 598 aa  369  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  38.2 
 
 		 541 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  35.05 
 
 		 586 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 588 aa  360  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  35.92 
 
 		 589 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  33.79 
 
 		 573 aa  358  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  34.29 
 
 		 579 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  34.72 
 
 		 583 aa  356  7.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  35.33 
 
 		 618 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  33.86 
 
 		 589 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  33.95 
 
 		 594 aa  351  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  33.5 
 
 		 592 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.76 
 
 		 586 aa  350  5e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  34.78 
 
 		 598 aa  349  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  33.86 
 
 		 587 aa  347  5e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  35.84 
 
 		 569 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  35.08 
 
 		 579 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  34.07 
 
 		 604 aa  343  4e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  33.85 
 
 		 583 aa  342  8e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  36 
 
 		 578 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  33.44 
 
 		 596 aa  341  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.74 
 
 		 583 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  35.08 
 
 		 600 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  33.87 
 
 		 585 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 593 aa  340  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  33.22 
 
 		 581 aa  339  8e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  34.06 
 
 		 593 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  33.51 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.51 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.51 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.51 
 
 		 583 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.51 
 
 		 583 aa  337  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.57 
 
 		 583 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  34.48 
 
 		 583 aa  335  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0818  ABC transporter related  38.21 
 
 		 569 aa  332  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153053  normal  0.572134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.91 
 
 		 583 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 583 aa  330  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  32.47 
 
 		 583 aa  329  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0495  ABC transporter related  34.01 
 
 		 603 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  34.79 
 
 		 572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  32.84 
 
 		 627 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  36.59 
 
 		 580 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  31.54 
 
 		 577 aa  325  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.27 
 
 		 581 aa  324  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  32.32 
 
 		 606 aa  323  6e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.44 
 
 		 598 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  37.08 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.41 
 
 		 578 aa  321  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.41 
 
 		 578 aa  321  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.51 
 
 		 593 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.5 
 
 		 586 aa  320  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.33 
 
 		 586 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  34.46 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  31.33 
 
 		 586 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3410  ABC transporter related  37.04 
 
 		 588 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.15 
 
 		 586 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  31.11 
 
 		 584 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.3 
 
 		 586 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  31.15 
 
 		 586 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  30.85 
 
 		 586 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.89 
 
 		 588 aa  316  7e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.86 
 
 		 575 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  30.98 
 
 		 586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.98 
 
 		 586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.12 
 
 		 555 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.81 
 
 		 591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  32.98 
 
 		 595 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  31.37 
 
 		 577 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.31 
 
 		 606 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0447  ABC transporter related  37.64 
 
 		 604 aa  310  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 598 aa  310  5.9999999999999995e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.02 
 
 		 588 aa  309  9e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.46 
 
 		 588 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.02 
 
 		 586 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  34.11 
 
 		 623 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>