More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2589 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  63.38 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  61.27 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  51.77 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  54.89 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.67 
 
 		 140 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.19 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  52.21 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  52.63 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  54.14 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.04 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.3 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.04 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.33 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  49.29 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  52.82 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  50 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  48.15 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  51.2 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  51.91 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  53.38 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  51.97 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.21 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.15 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  52.59 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  42.86 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.44 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.84 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.28 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  40.54 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.57 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.61 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29491  hypothetical protein  68.42 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  38.93 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  38.89 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.15 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.15 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  49.21 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  36.43 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.04 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  36.07 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  38.41 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.35 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  39.42 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.71 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.71 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.07 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.07 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.07 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.59 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  35.71 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.07 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.12 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.38 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  34.62 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.84 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  36.88 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.23 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.23 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  35.71 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  38.13 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.69 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01530  peptidyl-tRNA hydrolase  36.43 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.62 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.58 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.12 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  36.84 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.84 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  35.51 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  39.42 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.34 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.08 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  34.81 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  35.11 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.98 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  40.87 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  34.29 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.69 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.17 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  39.23 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  36.89 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.5 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  33.58 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  34.29 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  38.17 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.03 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  39.06 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.32 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0979  Class I peptide chain release factor  51.69 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  34.81 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.35 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.72 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>