210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2958 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  95.69 
 
 
325 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  96 
 
 
325 aa  660    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  86.46 
 
 
325 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  85.76 
 
 
325 aa  593  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  83.9 
 
 
325 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  83.59 
 
 
325 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  79.5 
 
 
325 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  76.31 
 
 
325 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  78.88 
 
 
323 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  76.23 
 
 
325 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  76 
 
 
325 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  75.69 
 
 
325 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  76.4 
 
 
325 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  75.69 
 
 
325 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  75.69 
 
 
325 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  76 
 
 
325 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  74.46 
 
 
325 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  75.38 
 
 
325 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  75.38 
 
 
325 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  75.62 
 
 
325 aa  534  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  74.46 
 
 
325 aa  530  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  74.77 
 
 
325 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  74.46 
 
 
325 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  75.62 
 
 
325 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  75 
 
 
325 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  75.31 
 
 
325 aa  529  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  75.31 
 
 
325 aa  529  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  75.47 
 
 
325 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  74.77 
 
 
325 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  74.15 
 
 
325 aa  525  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  74.15 
 
 
326 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  74.77 
 
 
329 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  74.3 
 
 
325 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  74.07 
 
 
325 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  75.73 
 
 
316 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  75.08 
 
 
319 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  70.68 
 
 
325 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  71.43 
 
 
326 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  71.43 
 
 
326 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  70.37 
 
 
325 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  69.44 
 
 
325 aa  488  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  69.44 
 
 
325 aa  485  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  71.3 
 
 
326 aa  477  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  76.47 
 
 
293 aa  477  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  65.53 
 
 
326 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  70.06 
 
 
326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  61.8 
 
 
326 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  60.87 
 
 
325 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  61.18 
 
 
326 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  61.18 
 
 
326 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  62.07 
 
 
326 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  77.63 
 
 
238 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  56.55 
 
 
323 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  53.99 
 
 
327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  53.99 
 
 
327 aa  350  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  54.14 
 
 
327 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  53.67 
 
 
327 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  52.4 
 
 
327 aa  345  7e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  53.35 
 
 
327 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  56.25 
 
 
325 aa  341  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  55.21 
 
 
325 aa  338  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  55.21 
 
 
325 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  54.51 
 
 
325 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  51.12 
 
 
325 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  51.12 
 
 
325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  50.8 
 
 
325 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  52.43 
 
 
325 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  50.48 
 
 
325 aa  321  9.000000000000001e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  49.2 
 
 
327 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  46.09 
 
 
370 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  81.22 
 
 
198 aa  309  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  77.22 
 
 
198 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  77.22 
 
 
198 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  76.34 
 
 
186 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  50.49 
 
 
329 aa  298  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  45.88 
 
 
347 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  45.45 
 
 
347 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  44.89 
 
 
328 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  45.62 
 
 
345 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  46.71 
 
 
336 aa  285  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  44.71 
 
 
349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  43.96 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  44.05 
 
 
341 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  44.35 
 
 
341 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  44.05 
 
 
341 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  51.74 
 
 
271 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  44.27 
 
 
344 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  43.96 
 
 
344 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  44.27 
 
 
344 aa  279  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  75.15 
 
 
186 aa  279  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  44.72 
 
 
341 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  43.96 
 
 
344 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  43.65 
 
 
344 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  40.63 
 
 
377 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  42.4 
 
 
370 aa  275  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  44.28 
 
 
345 aa  275  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  44.38 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  42.44 
 
 
324 aa  265  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  45.33 
 
 
336 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>