237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0924 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 245 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  84.9 
 
 		 245 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  80 
 
 		 245 aa  427  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  76.33 
 
 		 245 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  75.51 
 
 		 245 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  75.1 
 
 		 245 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  74.29 
 
 		 245 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  74.69 
 
 		 245 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  73.77 
 
 		 245 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  73.06 
 
 		 245 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  73.06 
 
 		 245 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  73.06 
 
 		 245 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  74.18 
 
 		 245 aa  387  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  67.76 
 
 		 245 aa  363  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  67.62 
 
 		 247 aa  360  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  67.21 
 
 		 244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  64.75 
 
 		 245 aa  347  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  63.11 
 
 		 245 aa  340  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  62.98 
 
 		 245 aa  327  9e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  56.56 
 
 		 244 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  76.16 
 
 		 172 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  52.03 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  40.65 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  37.94 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  38.37 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  38.46 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  39.06 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  38.86 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  39.74 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  34.96 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  33.88 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  69.12 
 
 		 68 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  28.09 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  28.32 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  29 
 
 		 409 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  27.4 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  28.94 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.5 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.16 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  25.42 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.26 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  26.34 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  26.84 
 
 		 413 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  28.22 
 
 		 409 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  25.43 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  24.35 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  24.59 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  24.14 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  26.41 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  26.86 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  27.67 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  26.25 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  33.56 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  28.69 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  26.98 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  36.13 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  26.23 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  27.31 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  26.72 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  25.88 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  25.64 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  26.36 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  26.2 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  24.58 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  23.39 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 232 aa  62  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  24.5 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  25.42 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  25.42 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  23.55 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  26.18 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  25.22 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  27.09 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  23.63 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  24.15 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  23.04 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  25.74 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  25.47 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  26.27 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  26.27 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>