57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0905 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  83.63 
 
 		 425 aa  665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  100 
 
 		 424 aa  845    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  75.81 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  75.06 
 
 		 424 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  75.06 
 
 		 424 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  75.06 
 
 		 424 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  75.81 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  72.03 
 
 		 421 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  75.06 
 
 		 424 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  74.81 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  75.31 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  77.72 
 
 		 382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  73.53 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  51.61 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  50.38 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  48.79 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  46.02 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  43.47 
 
 		 420 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  40.61 
 
 		 428 aa  316  5e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  42.54 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  43.86 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  45.04 
 
 		 422 aa  298  9e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  40.81 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  41.28 
 
 		 423 aa  279  7e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  37.47 
 
 		 437 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  37.47 
 
 		 437 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  38.52 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  41.15 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  37.8 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  37.8 
 
 		 434 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  36.97 
 
 		 435 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  36.24 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  36.78 
 
 		 421 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  38.65 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  38.13 
 
 		 433 aa  239  8e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  36.25 
 
 		 418 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  36.87 
 
 		 460 aa  225  9e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  36.69 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  36.21 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.97 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  24.42 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  24.5 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  26.54 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3851  hypothetical protein  87.1 
 
 		 48 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  28.67 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  90 
 
 		 52 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  22.01 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  20.72 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  23.14 
 
 		 508 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  28.73 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  32.93 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 659 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  30.56 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  24.26 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  25.31 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  27.62 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>