More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1967 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  100 
 
 
1194 aa  2459    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1992  hypothetical protein  46.14 
 
 
521 aa  354  5.9999999999999994e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  42.36 
 
 
532 aa  334  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  52.96 
 
 
457 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  54.05 
 
 
548 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  39.72 
 
 
518 aa  318  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  43.47 
 
 
578 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  54.95 
 
 
524 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1968  hypothetical protein  45.22 
 
 
425 aa  234  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  44.85 
 
 
820 aa  219  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  35.12 
 
 
560 aa  205  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  48.83 
 
 
625 aa  198  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  52.38 
 
 
526 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  52.44 
 
 
758 aa  183  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3216  metallophosphoesterase  30.29 
 
 
593 aa  178  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.362969  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1961  hypothetical protein  36.94 
 
 
300 aa  177  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1398  metallophosphoesterase  31.45 
 
 
435 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34858  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  50.3 
 
 
218 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  33.33 
 
 
935 aa  168  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  35.85 
 
 
685 aa  167  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  32.04 
 
 
693 aa  164  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
460 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  30.36 
 
 
932 aa  153  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2791  metallophosphoesterase  26.59 
 
 
465 aa  149  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1962  hypothetical protein  31.8 
 
 
298 aa  145  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  40.88 
 
 
629 aa  144  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  44.44 
 
 
1009 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  29.88 
 
 
1174 aa  142  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
440 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  28.97 
 
 
422 aa  138  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  28.12 
 
 
573 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.62 
 
 
995 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  39.34 
 
 
506 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  26.89 
 
 
468 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  28.84 
 
 
442 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  43.1 
 
 
1821 aa  135  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  39.77 
 
 
288 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.76 
 
 
1016 aa  132  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  39.88 
 
 
1321 aa  131  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.02 
 
 
1029 aa  129  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  45 
 
 
767 aa  129  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0784  metallophosphoesterase  27.52 
 
 
499 aa  128  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  32.46 
 
 
524 aa  127  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1559  metallophosphoesterase  25.37 
 
 
455 aa  126  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0813255  normal  0.653496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  39.02 
 
 
926 aa  126  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  38.24 
 
 
920 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3496  hypothetical protein  31.69 
 
 
557 aa  124  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.359328  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  42.17 
 
 
542 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  26.5 
 
 
730 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  26.29 
 
 
506 aa  122  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31450  phosphoesterase  27.56 
 
 
426 aa  121  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  39.76 
 
 
1226 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  38.55 
 
 
223 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  29.19 
 
 
680 aa  119  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  38.33 
 
 
710 aa  119  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  38.33 
 
 
1081 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  37.93 
 
 
531 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  42.6 
 
 
1208 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  33.7 
 
 
554 aa  116  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  27.2 
 
 
1847 aa  116  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  33.57 
 
 
618 aa  116  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  37.65 
 
 
1013 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  26.79 
 
 
1168 aa  115  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  29.21 
 
 
756 aa  115  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.35 
 
 
1328 aa  110  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  32.11 
 
 
921 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  30.6 
 
 
3027 aa  109  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  36.78 
 
 
692 aa  109  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  35.84 
 
 
4630 aa  108  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  35.03 
 
 
548 aa  107  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  35.96 
 
 
1154 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  30.64 
 
 
394 aa  105  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  35.06 
 
 
660 aa  105  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  26.02 
 
 
643 aa  104  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  29.46 
 
 
547 aa  104  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  35.88 
 
 
1042 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  32.76 
 
 
834 aa  103  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  28.22 
 
 
473 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  45.22 
 
 
286 aa  102  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09660  Calcineurin-like phosphoesterase  24.61 
 
 
898 aa  101  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0235626  normal  0.450743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1132  metallophosphoesterase  28.91 
 
 
305 aa  101  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  34.91 
 
 
1710 aa  100  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  36.31 
 
 
620 aa  100  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  27.9 
 
 
529 aa  100  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  27.44 
 
 
632 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  34.25 
 
 
733 aa  99  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  35.71 
 
 
620 aa  98.6  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.81 
 
 
1661 aa  99  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  35.71 
 
 
620 aa  98.2  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  24.4 
 
 
515 aa  98.2  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  29.94 
 
 
1260 aa  97.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  35.75 
 
 
413 aa  96.3  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  32.61 
 
 
631 aa  95.9  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  32.53 
 
 
1223 aa  95.9  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  32.74 
 
 
657 aa  95.9  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.68 
 
 
1054 aa  95.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  27.37 
 
 
686 aa  95.1  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  26.01 
 
 
1139 aa  94  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  33.54 
 
 
615 aa  93.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  30.77 
 
 
447 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>