27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1961 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1961  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  614  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1962  hypothetical protein  41.5 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  36.94 
 
 
1194 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  37.87 
 
 
518 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  37.45 
 
 
524 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1968  hypothetical protein  36.19 
 
 
425 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3496  hypothetical protein  31.85 
 
 
557 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.359328  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  32.73 
 
 
935 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  29.82 
 
 
506 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  32.58 
 
 
758 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  28.15 
 
 
625 aa  49.3  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3479  protein of unknown function DUF1533  30.49 
 
 
428 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.22 
 
 
788 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 
788 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.99 
 
 
788 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.26 
 
 
788 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
788 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  26.54 
 
 
428 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.54 
 
 
788 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.22 
 
 
788 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.26 
 
 
788 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  33.33 
 
 
1226 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
790 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.26 
 
 
788 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  29.14 
 
 
258 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  34.67 
 
 
247 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  34.67 
 
 
247 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>