More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0564 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  269  9e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  45.31 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  45.04 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  43.65 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  41.35 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  43.38 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  41.61 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  38.64 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  38.57 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  38.76 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  37.8 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  40.77 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  37.3 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  38.46 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  40.31 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  38.28 
 
 		 133 aa  95.9  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  38.28 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  35.94 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  37.4 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  36.72 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  39.85 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  32.81 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  35.07 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  31.39 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  37.04 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  37.69 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  37.04 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  33.85 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  32.09 
 
 		 190 aa  88.6  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  37.01 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  35.51 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  36.88 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  37.01 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  37.01 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  37.01 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  32.54 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  36.15 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  38.81 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  34.81 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  37.04 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  32.03 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  30.71 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  30.71 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  39.45 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  39.6 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  34.38 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  30.71 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  34.48 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  35.11 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  32.03 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 164 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  36.64 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  32.82 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  32.82 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  34.62 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  36.89 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  35.07 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  36.92 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  33.83 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  32.06 
 
 		 167 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  32.31 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  36.22 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  31.5 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  32.62 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  33.58 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  43.21 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  37.04 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  36.43 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>