More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0339 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0339  putative sulfonate transport system ATP-binding protein  100 
 
 		 231 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1146  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318577  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0243  ABC transporter related  48.64 
 
 		 240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.498468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  55.56 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0720  ABC transporter related  44.54 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0744  ABC transporter related  44.98 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  38.29 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  37.08 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 		 262 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  41.32 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  41.32 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  41.42 
 
 		 256 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 284 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  40.59 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 261 aa  168  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  41.38 
 
 		 244 aa  168  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 261 aa  167  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  38.56 
 
 		 281 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  40.17 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  42.28 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  39.33 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  41.77 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  37.55 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  39.42 
 
 		 265 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  39.58 
 
 		 276 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  37.76 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  39.24 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  38.08 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  38.57 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  38.02 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  36.44 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  39.75 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  38.36 
 
 		 281 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  39.42 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  38.27 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  36.78 
 
 		 285 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  38.08 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  38.36 
 
 		 281 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  38.36 
 
 		 281 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  38.82 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  39.51 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  39.67 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  39.67 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  39.67 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  35.66 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  38.33 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  37.29 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  36.82 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.23 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  36.25 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  37.83 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  39.34 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  41.36 
 
 		 258 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  38.63 
 
 		 273 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  40.18 
 
 		 264 aa  158  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  36.36 
 
 		 258 aa  158  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 252 aa  158  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  37.07 
 
 		 281 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  38.27 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  39.75 
 
 		 265 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  38.11 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  35.95 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  38.57 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1866  ABC transporter related  41.2 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  39 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.26 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  42.86 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  36.89 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  38.39 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  39.75 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  36.33 
 
 		 287 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  37.24 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  38.92 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  34.17 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  39 
 
 		 266 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  36.93 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  39.06 
 
 		 268 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  34.8 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  37.12 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  38.03 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  36.21 
 
 		 281 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  39.9 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1574  ABC transporter related  36.73 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212668  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  37.34 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  37.24 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  37.93 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  38.57 
 
 		 298 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 		 287 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  37.86 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.6 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  35.98 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  37.55 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  37.95 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>