More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1574 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1574  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  44.18 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  44.03 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1574  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.42 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  44.98 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  43.21 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  43.15 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  45.45 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  45.27 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  42.97 
 
 		 278 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  42.29 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  40.83 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  42.21 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  40.91 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  40.66 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0399  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.5 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  41.37 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  42.4 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  43.1 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  45.08 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  41.34 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  43.32 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.08 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.79 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  42.98 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  41.63 
 
 		 289 aa  190  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  41.63 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.04 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  42.08 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  42.08 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  42.11 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  42.5 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  40.23 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  41.34 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  42.91 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.39 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.08 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  42.74 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  40.48 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.39 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  45.41 
 
 		 311 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  41.06 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  41.32 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  42.91 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  41.37 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  40.57 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.39 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.57 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.96 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  42.17 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  42.17 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  39.61 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  42.42 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  45.2 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1745  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00365459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  44.35 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  40.73 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  41.49 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  43.39 
 
 		 281 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  41.6 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  42.56 
 
 		 279 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  40.08 
 
 		 258 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.39 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  40.91 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  40.89 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  39.76 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  40.56 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  41.3 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  40.32 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  39.43 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  40.91 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  39.2 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  40.08 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.4 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  40.4 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  41.25 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>