271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4930 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 492 aa  981    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  91.53 
 
 		 410 aa  336  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  50.51 
 
 		 991 aa  280  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  50.51 
 
 		 991 aa  280  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  49.66 
 
 		 997 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  45.48 
 
 		 916 aa  223  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  43.1 
 
 		 1006 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  44.14 
 
 		 1029 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  41 
 
 		 1075 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  40.34 
 
 		 1028 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  46.77 
 
 		 771 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  54.44 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  54.44 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  54.44 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  54.44 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  54.44 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  54.44 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  54.44 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  54.44 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  54.44 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  27.38 
 
 		 612 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6842  putative insertion sequence transposase protein  47.92 
 
 		 146 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  29.85 
 
 		 983 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  37.78 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  37.78 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  30.71 
 
 		 988 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  30.6 
 
 		 988 aa  99.8  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  30.6 
 
 		 988 aa  99.8  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  30.36 
 
 		 988 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  26.12 
 
 		 992 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  29.48 
 
 		 987 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  27.8 
 
 		 990 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  27.8 
 
 		 990 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  27.8 
 
 		 990 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  27.8 
 
 		 990 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  29.89 
 
 		 989 aa  90.9  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  28.11 
 
 		 988 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  28.11 
 
 		 988 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  28.11 
 
 		 988 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  28.11 
 
 		 988 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  25.98 
 
 		 526 aa  90.1  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  27.44 
 
 		 990 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  30.56 
 
 		 988 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  30.56 
 
 		 988 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  30.56 
 
 		 988 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 731 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  39.55 
 
 		 413 aa  87  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  28.32 
 
 		 988 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  28.32 
 
 		 988 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  28.32 
 
 		 988 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  28.93 
 
 		 988 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  27.08 
 
 		 990 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  27.08 
 
 		 990 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  28.37 
 
 		 988 aa  83.6  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  28.67 
 
 		 988 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  31.75 
 
 		 996 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  31.75 
 
 		 996 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  31.75 
 
 		 996 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  28.06 
 
 		 1015 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  26.62 
 
 		 964 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  36.11 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  36.11 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  27.93 
 
 		 988 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  39.36 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  23.27 
 
 		 738 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4667  transposase  35.14 
 
 		 123 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  29.39 
 
 		 994 aa  76.6  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  29.29 
 
 		 877 aa  76.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  31.7 
 
 		 400 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  25.38 
 
 		 990 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  30.85 
 
 		 996 aa  73.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  28.01 
 
 		 989 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.76 
 
 		 989 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  35.88 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  35.88 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  35.88 
 
 		 507 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  35.88 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3975  hypothetical protein  25.82 
 
 		 236 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  35.11 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  35.11 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  35.11 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  35.11 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  35.11 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  26.33 
 
 		 992 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  26.33 
 
 		 992 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  37.32 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  37.32 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  37.32 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  23.47 
 
 		 985 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  25.27 
 
 		 994 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  25.81 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  25.27 
 
 		 994 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  36.49 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  38.37 
 
 		 838 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  32.26 
 
 		 968 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  34.35 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>