More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2756 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 354 aa  687    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  35.23 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  34.24 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  32.62 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  34.92 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  35.27 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  35.86 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  32.62 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  34.31 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  25.1 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  30.53 
 
 		 278 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.92 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.93 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.53 
 
 		 280 aa  92.8  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.64 
 
 		 268 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  35.96 
 
 		 504 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  32.5 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 478 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 487 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 445 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 500 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  38 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  41.67 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  29.56 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  29.56 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  33.67 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  36.14 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  27.69 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  33.7 
 
 		 560 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  33.67 
 
 		 524 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  33.7 
 
 		 572 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  33.7 
 
 		 572 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  33.7 
 
 		 572 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  33.7 
 
 		 572 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  30.56 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  33.7 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  33.7 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  32.6 
 
 		 593 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  33.02 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  35.53 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  33.85 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  33.52 
 
 		 589 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  29.2 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  31 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  33.13 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  33.7 
 
 		 590 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  33.7 
 
 		 569 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  33.7 
 
 		 562 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  31.49 
 
 		 588 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  31.02 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  39.31 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  31.49 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  37.29 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  34 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  33.14 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  31.49 
 
 		 588 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  30.33 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  35.5 
 
 		 567 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  31.49 
 
 		 588 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  28.51 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  29.15 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  36.73 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  30.58 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  29.86 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  31.36 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  30.05 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  36.76 
 
 		 569 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  28.12 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  38.73 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.18 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  31.64 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  32.64 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2687  peptidase M48, Ste24p  33.15 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  34.67 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  31.64 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  27.63 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  31.72 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  29.57 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  34.18 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  30.81 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  27.66 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  32.8 
 
 		 554 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>