288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1699 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 329 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  48.64 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  47.01 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  45.29 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  46.53 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  38.34 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  36.23 
 
 		 343 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  37.66 
 
 		 340 aa  202  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  30.68 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  36.11 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  36.11 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.43 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  33.84 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 		 348 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  35.4 
 
 		 341 aa  188  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.82 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  35.26 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  34.95 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  35.2 
 
 		 590 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  35.11 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  34.53 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  38.25 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  31.69 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.42 
 
 		 342 aa  172  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  31.38 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  33.44 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  33.75 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  30.86 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  34.11 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  31.03 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  31.46 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.86 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.05 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  30.86 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  31.09 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  31.09 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.09 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  30.86 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  30.56 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  31.09 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  30.84 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  30.27 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  27.93 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  28.49 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  31.95 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  33.03 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  29.45 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  29.02 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  27.62 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  32.02 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  35.37 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  32 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  28.78 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  29.1 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  30.28 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  31 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  29.73 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  31.19 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  29.75 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  33.63 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  33.86 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  28.32 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  31.38 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  29.33 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  34.08 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  34.34 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  28.15 
 
 		 360 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  34.74 
 
 		 326 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  32.16 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  32.3 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  30.33 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  29.36 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  31.01 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  32.91 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  31.69 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  31.49 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.93 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  32.75 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  39.7 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.83 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.94 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  33.46 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  32.16 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.14 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  32.24 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  29.81 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.45 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  31.54 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  34.63 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  29.28 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  27.46 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.81 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  29.64 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  29.81 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>