More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1569 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
525 aa  1055    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  40.35 
 
 
520 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  39.92 
 
 
514 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  39.5 
 
 
530 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  39.45 
 
 
503 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  37.35 
 
 
497 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.25 
 
 
507 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.71 
 
 
503 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.36 
 
 
509 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  33.85 
 
 
509 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  30.93 
 
 
587 aa  240  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  34.16 
 
 
518 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.29 
 
 
622 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.96 
 
 
555 aa  236  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.5 
 
 
618 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.02 
 
 
615 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.22 
 
 
530 aa  230  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.38 
 
 
568 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  33.94 
 
 
537 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.38 
 
 
573 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.38 
 
 
573 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.36 
 
 
569 aa  227  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.01 
 
 
542 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.01 
 
 
542 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  38.01 
 
 
547 aa  226  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  32.42 
 
 
520 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.94 
 
 
555 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.32 
 
 
554 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.22 
 
 
554 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.32 
 
 
554 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.4 
 
 
554 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  29.4 
 
 
554 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  29.96 
 
 
554 aa  224  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.14 
 
 
554 aa  223  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.36 
 
 
552 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.1 
 
 
605 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.2 
 
 
554 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.09 
 
 
580 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  36.36 
 
 
570 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  36.36 
 
 
570 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.49 
 
 
523 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.41 
 
 
561 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  36.14 
 
 
565 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.19 
 
 
574 aa  210  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.99 
 
 
569 aa  210  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.12 
 
 
597 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.52 
 
 
555 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  32.15 
 
 
537 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  37.74 
 
 
547 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  35.26 
 
 
481 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.4 
 
 
511 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 
564 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
577 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  29.12 
 
 
578 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
564 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
550 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
570 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  27.19 
 
 
581 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  30.73 
 
 
501 aa  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  28.9 
 
 
572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  32.61 
 
 
547 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
561 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  30.87 
 
 
552 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
553 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
553 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
555 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.3 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  28.16 
 
 
555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  27.55 
 
 
553 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
558 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
553 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
553 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
553 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
553 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
545 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
541 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
579 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  32.11 
 
 
500 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
563 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
551 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
569 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
583 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
540 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
553 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
544 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
559 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
545 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
559 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  32.16 
 
 
586 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  27.71 
 
 
525 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
569 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  30.33 
 
 
557 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  29.02 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  26.68 
 
 
537 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  26.68 
 
 
537 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  29.85 
 
 
522 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>