71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1485 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  969    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  63.75 
 
 		 486 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  55.06 
 
 		 854 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  38.41 
 
 		 495 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  38.43 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  37.82 
 
 		 495 aa  256  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  35.58 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  30.78 
 
 		 489 aa  170  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  27.56 
 
 		 501 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  27.56 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  31.05 
 
 		 494 aa  96.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  25.77 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  28.14 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  28.95 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  28.05 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  27.92 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  26.98 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  27.89 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  25.72 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  25.55 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  24.33 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  24.33 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  24.33 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  26.13 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  24.27 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  28.8 
 
 		 513 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  28.8 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  25.49 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  19.54 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  28.27 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  20.85 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  28.27 
 
 		 513 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  25.82 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.81 
 
 		 1844 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  27.57 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  28.89 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  24.12 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  31.18 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  25.8 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  23.4 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  26.92 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  27.78 
 
 		 454 aa  52  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  22.36 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  23.2 
 
 		 461 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  26.21 
 
 		 945 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  22.83 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  22.83 
 
 		 457 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  26.34 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  28.33 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.51 
 
 		 1016 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  33.58 
 
 		 345 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  23.56 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  25.65 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  25.91 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  26.58 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  24.52 
 
 		 410 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  26.09 
 
 		 453 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  25.37 
 
 		 1175 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  32.87 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  23.68 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  27.51 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  23.27 
 
 		 998 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  24.1 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  27.66 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  24.04 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  27.51 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  22.71 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  25.11 
 
 		 384 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  25.29 
 
 		 473 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  24.91 
 
 		 399 aa  43.5  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>