More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1190 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  224  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  56.6 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  56.19 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  58.59 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  55.14 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  56.19 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  54.63 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  55.67 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  52.88 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  54.37 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  52.53 
 
 		 185 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  46.9 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  51.52 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.51 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46.94 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  47.78 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  45.28 
 
 		 330 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  45.54 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  49.48 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  46.23 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 113 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  43.12 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  43.12 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  44.34 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  50.55 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  43.3 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0818  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  42 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  42 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  43 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  52.05 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  34 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>