138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37690 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  100 
 
 		 145 aa  279  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  41.43 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  47.5 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  40.74 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  37.33 
 
 		 175 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  37.41 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  38.81 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  46.99 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  39.39 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  41.11 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  39.39 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  39.39 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  46.99 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  39.2 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  43.53 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  43.02 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  35.04 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  48.68 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  29.89 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  50 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  26.97 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  28.42 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  39.76 
 
 		 547 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  41.1 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  29.79 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  27.17 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  33.75 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  35 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  30.77 
 
 		 460 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  29.79 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  29.79 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  29.67 
 
 		 461 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  29.67 
 
 		 461 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  30 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  30.53 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  26.58 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  34.34 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  37.93 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  39.71 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  29.73 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  33.33 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  27.84 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  32.91 
 
 		 459 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  25.53 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  30.68 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  30.93 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  30 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  23.6 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  29.67 
 
 		 458 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  23.16 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  32.58 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  26.67 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  31.82 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  29.27 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  37.08 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  30.95 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  30.25 
 
 		 259 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  27.37 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  28.57 
 
 		 456 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  27.37 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  27.37 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  36.23 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  30.34 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  34.15 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  29.55 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  30.36 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  29.11 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  29.03 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  23.26 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  28.72 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  27.37 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  28.57 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  23.47 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  23.81 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  41.3 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  31.65 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  28.72 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  28.72 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  32.18 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  25.27 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  22.99 
 
 		 104 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  26.32 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1805  thiol-disulfide interchange protein  38.2 
 
 		 179 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  27.66 
 
 		 124 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  26.32 
 
 		 125 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  34.88 
 
 		 141 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  28.57 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  27.62 
 
 		 110 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  29.55 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0451  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  38.2 
 
 		 179 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  29.63 
 
 		 98 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  32.93 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  28.92 
 
 		 105 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  29.21 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  30 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>