More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24950 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 637 aa  1301    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.46 
 
 		 635 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  45.84 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  46.24 
 
 		 679 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  47.17 
 
 		 652 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  45.73 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  45.73 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  45.73 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.95 
 
 		 654 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.15 
 
 		 634 aa  484  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.9 
 
 		 570 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 		 638 aa  365  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 		 670 aa  351  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 653 aa  350  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  36.8 
 
 		 727 aa  347  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.28 
 
 		 607 aa  346  8.999999999999999e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.79 
 
 		 655 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 		 583 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.15 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 		 702 aa  320  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 839 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 		 635 aa  303  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.65 
 
 		 618 aa  292  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 		 677 aa  291  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 		 692 aa  290  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 		 657 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.33 
 
 		 716 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  31.32 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.04 
 
 		 657 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 553 aa  284  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.77 
 
 		 682 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 		 662 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 		 582 aa  277  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.82 
 
 		 754 aa  277  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.9 
 
 		 657 aa  277  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 600 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.99 
 
 		 663 aa  276  8e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.62 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 		 716 aa  272  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0480  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 574 aa  268  2.9999999999999995e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.64 
 
 		 654 aa  267  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 579 aa  266  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1107  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  31.61 
 
 		 613 aa  265  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.04 
 
 		 571 aa  264  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 		 581 aa  259  9e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.88 
 
 		 660 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  31.22 
 
 		 729 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 		 705 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 		 657 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.65 
 
 		 695 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  32.38 
 
 		 582 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 		 631 aa  250  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  31.81 
 
 		 556 aa  250  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 		 619 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  30.9 
 
 		 552 aa  247  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  30.9 
 
 		 548 aa  247  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 		 570 aa  246  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  32.38 
 
 		 605 aa  246  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1250  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 592 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0497738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 		 568 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.62 
 
 		 582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  31.62 
 
 		 582 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  32.65 
 
 		 577 aa  244  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 		 586 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  32.8 
 
 		 575 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.68 
 
 		 608 aa  243  7.999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  29.32 
 
 		 727 aa  243  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  30.56 
 
 		 583 aa  243  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 		 583 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 		 595 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  30.5 
 
 		 708 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.2 
 
 		 614 aa  241  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 		 590 aa  239  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.66 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  29.05 
 
 		 727 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 		 595 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 		 578 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.44 
 
 		 582 aa  238  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  30.3 
 
 		 579 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  30.32 
 
 		 575 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  30.56 
 
 		 581 aa  237  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 		 584 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  29.88 
 
 		 711 aa  237  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  30.13 
 
 		 579 aa  237  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.92 
 
 		 740 aa  236  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  29.51 
 
 		 579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  32.06 
 
 		 600 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 613 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  31.67 
 
 		 595 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  29.43 
 
 		 582 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 		 613 aa  234  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.63 
 
 		 703 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 		 570 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  30.58 
 
 		 585 aa  233  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 		 708 aa  233  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 		 582 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08800  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.8 
 
 		 557 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000196168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  32.82 
 
 		 587 aa  231  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>