More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  100 
 
 		 498 aa  979    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  68.36 
 
 		 498 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  46.23 
 
 		 494 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  47.05 
 
 		 494 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  46.61 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  45.07 
 
 		 509 aa  359  5e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  43.06 
 
 		 514 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  43.4 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  42.66 
 
 		 507 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  42.66 
 
 		 507 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  42.25 
 
 		 507 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  41.91 
 
 		 481 aa  303  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  42.25 
 
 		 502 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  40.24 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  41.48 
 
 		 484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  40.85 
 
 		 480 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  39.35 
 
 		 522 aa  262  8e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  41.95 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  38.87 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  38.74 
 
 		 494 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  38.92 
 
 		 490 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  36.31 
 
 		 549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  35.7 
 
 		 536 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  35.59 
 
 		 547 aa  239  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  41.68 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  37.83 
 
 		 498 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  36.75 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  35.4 
 
 		 549 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  39.26 
 
 		 572 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  38.14 
 
 		 508 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  39.42 
 
 		 558 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  43.14 
 
 		 288 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.19 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  46.34 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  27.7 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  29.67 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  41.18 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50510  predicted protein  27.37 
 
 		 647 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  44.44 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.84 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  45.57 
 
 		 284 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  41.33 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.3 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  45.56 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  36 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  45.56 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  45.56 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  29.51 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.33 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  31.07 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  25.93 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  40.79 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  30 
 
 		 202 aa  57  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  30.12 
 
 		 200 aa  57  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2470  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112991  hitchhiker  0.0000511944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 280 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  32.05 
 
 		 200 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  31.01 
 
 		 202 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  27 
 
 		 200 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  44.83 
 
 		 284 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.25 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  46.05 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  39.47 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.254122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  41.38 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.82 
 
 		 276 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  46.67 
 
 		 280 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  32.48 
 
 		 378 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48 
 
 		 283 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1667  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.75 
 
 		 294 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  43.84 
 
 		 274 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  44.74 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  44.74 
 
 		 282 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  44.74 
 
 		 282 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  36.05 
 
 		 280 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  44.74 
 
 		 282 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  38.2 
 
 		 283 aa  54.3  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  34.23 
 
 		 386 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  32.93 
 
 		 240 aa  53.9  0.000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  38.46 
 
 		 198 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.05 
 
 		 340 aa  53.9  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  29.6 
 
 		 210 aa  53.9  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.77 
 
 		 343 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  26.39 
 
 		 287 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  43.42 
 
 		 280 aa  53.5  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  32.35 
 
 		 231 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.32 
 
 		 280 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  32.18 
 
 		 220 aa  53.1  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  37.33 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  35.87 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0650  hypothetical protein  27.61 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.348415  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2759  modification methylase, HemK family  35.83 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.11 
 
 		 280 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  37.69 
 
 		 295 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2379  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.83 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  29.46 
 
 		 202 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  38.64 
 
 		 277 aa  52.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2548  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.25 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  45.33 
 
 		 285 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  32.43 
 
 		 288 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.5 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>