282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1188 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1188  ApbE-like lipoprotein  100 
 
 		 303 aa  613  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  26.75 
 
 		 360 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  27.36 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  31.68 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  26.73 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  26.76 
 
 		 331 aa  99  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  25.84 
 
 		 336 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  26.84 
 
 		 317 aa  95.5  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  28.57 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  24.58 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.5 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  24 
 
 		 365 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  26.84 
 
 		 369 aa  89.7  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  27.44 
 
 		 350 aa  89.4  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  23.18 
 
 		 339 aa  89.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.25 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  23.43 
 
 		 368 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  25.65 
 
 		 370 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 		 346 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.87 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  25.83 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  26.06 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  23.05 
 
 		 386 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  25.93 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  28.9 
 
 		 338 aa  85.9  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  28.71 
 
 		 342 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  22.77 
 
 		 331 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  24.26 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0909  ApbE family lipoprotein  27.03 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.503634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  28.39 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  25.18 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  24.55 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  24.55 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  26.76 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  26 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  27.17 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2110  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.3 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  24.11 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.81 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  29.49 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  28.09 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  24.35 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  26.77 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  25.1 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  23.96 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  24.66 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  23.79 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  26.3 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.72 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.08 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  26.8 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  25.44 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  24.63 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  26.23 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  22.93 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.91 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  26.89 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  24.38 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  26.69 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.96 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.35 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  27.55 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  22.99 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  24.24 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  25.74 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  24.72 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  26.14 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  27.68 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  22.58 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  24.22 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  23.83 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.65 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.45 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  23.83 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1418  apbE family protein  25.58 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  24.22 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  22.66 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  26.92 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.82 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  24.22 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  26.34 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  26.33 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  24.82 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.15 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  29.03 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.69 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  25.56 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  25.56 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  25.56 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  25.48 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  26.61 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  25.56 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>