More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0860 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 435 aa  896    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 567 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0765  prolyl-tRNA synthetase  67.21 
 
 		 567 aa  343  5e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0150989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1050  prolyl-tRNA synthetase  67.66 
 
 		 566 aa  341  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 569 aa  341  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 444 aa  339  5e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 439 aa  338  9e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1387  prolyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0647  prolyl-tRNA synthetase  62.3 
 
 		 569 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.785979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 445 aa  336  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0568  prolyl-tRNA synthetase  62.3 
 
 		 569 aa  336  5.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.418089  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 424 aa  335  7e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0769  prolyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 565 aa  330  4e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 440 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0689  prolyl-tRNA synthetase  63.83 
 
 		 567 aa  326  5e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 442 aa  322  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 442 aa  319  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 440 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 439 aa  318  9e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 498 aa  317  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 439 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 445 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 445 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 445 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 452 aa  303  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 436 aa  298  9e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 570 aa  282  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 570 aa  282  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 576 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 580 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 573 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  53.42 
 
 		 575 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 571 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 564 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 574 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 579 aa  272  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 572 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 567 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 567 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 576 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 571 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 571 aa  269  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 580 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 570 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 573 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 573 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03186  prolyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 564 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 571 aa  266  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 578 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 572 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  47.39 
 
 		 572 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 572 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 572 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 572 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 572 aa  266  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 578 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>