More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0817 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  38.8 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.75 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  39.5 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  39.5 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  39.53 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.6 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  32.32 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.33 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  32.14 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  31.75 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  31.75 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  31.75 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.99 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  31.75 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  31.37 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  31.5 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.68 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5485  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.25 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.16 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  32.78 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  32.78 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  32.78 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.24 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  32.78 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  32.78 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3132  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.74 
 
 		 296 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  32.28 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  31.89 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  31.5 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  33.2 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  31.66 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.8 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  32.31 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2431  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.7 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.59 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1352  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.86 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1654  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.86 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4143  formate dehydrogenase subunit FdhD  31.4 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.47 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.66 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  28.08 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.64 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.68 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.13 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  28.74 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02271  hypothetical protein  26.44 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  31.98 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1126  formate dehydrogenase accessory protein  26.56 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.85 
 
 		 263 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0690  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.97 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0839  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.97 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.734645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0343  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.81 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00229888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.35 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.6 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.21 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1624  formate dehydrogenase accessory protein  31.2 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.1 
 
 		 483 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1909  formate dehydrogenase, subunit FdhD  25.79 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3756  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.33 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4819  formate dehydrogenase subunit FdhD  27.42 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.06 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.58 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4130  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.66 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.142791  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4218  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.66 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072328  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4100  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.66 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0239  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.66 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.43 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.09 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4427  formate dehydrogenase, subunit FdhD  27.2 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.73 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0990  hypothetical protein  29.76 
 
 		 506 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003500  formate dehydrogenase chain D  25.67 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.81 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.503102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  30.92 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3282  putative formate dehydrogenase accessory protein FdhD  29.96 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.610509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  30.92 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3910  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  28.93 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3645  formate dehydrogenase accessory protein  30.92 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259742 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3714  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.81 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.525322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.09 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  29.46 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  29.46 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0053  formate dehydrogenase, subunit FdhD  27 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3715  formate dehydrogenase subunit FdhD  24.71 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351414  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.85 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0919  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.86 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  30.37 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0838  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.74 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0377992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.06 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29960  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.62 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3785  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.81 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0292467  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  31.18 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.57 
 
 		 479 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.47 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4473  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.98 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.979472  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0300  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.92 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.6 
 
 		 468 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>