More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2076 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  70.56 
 
 		 255 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  68.15 
 
 		 255 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  70.08 
 
 		 483 aa  358  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  68.8 
 
 		 487 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  68.8 
 
 		 479 aa  344  8.999999999999999e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  63.85 
 
 		 468 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  67.49 
 
 		 468 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  66.4 
 
 		 478 aa  328  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  61.51 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2990  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  60.32 
 
 		 255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68227e-19 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  34.38 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  34.38 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.9 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  33.59 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  33.59 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  33.59 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  33.59 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  33.97 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  33.59 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  33.21 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  33.59 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.34 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  33.46 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  30.5 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  31.47 
 
 		 269 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  32.02 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.51 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  33.6 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.96 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.89 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.05 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.14 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.4 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.54 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  30.16 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.29 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.27 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.06 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  33.48 
 
 		 223 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.91 
 
 		 281 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  33.59 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  31.47 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.34 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.29 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  32.68 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.93 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4819  formate dehydrogenase subunit FdhD  30.59 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.59 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4427  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.89 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  30.47 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.57 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  30.95 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  30.83 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.19 
 
 		 299 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  29.48 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3516  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.78 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.22 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3282  putative formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.47 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.610509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1448  putative formate dehydrogenase accessory protein  30.83 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2010  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.12 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.068526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3467  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.27 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0053  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.61 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1176  putative fdhD protein  31.71 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.108793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0839  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.08 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.145713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  28.85 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  31.47 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.68 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.59 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.121584  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.02 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3715  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.03 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351414  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.27 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.69 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  28.46 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.2 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.08 
 
 		 274 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02271  hypothetical protein  30.68 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1126  formate dehydrogenase accessory protein  30.16 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3619  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  29.84 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4503  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  29.51 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003500  formate dehydrogenase chain D  29.48 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  28.22 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.71 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.9 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0343  formate dehydrogenase, subunit FdhD  31.15 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00229888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  29.7 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  29.43 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2756  formate dehydrogenase subunit FdhD  32.38 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000145311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5485  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.99 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4143  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.27 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  30.8 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>