More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2122 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  52.69 
 
 		 261 aa  281  9e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1042  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  53.6 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  57.14 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2220  hypothetical protein  46.26 
 
 		 246 aa  201  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1513  formate dehydrogenase subunit FdhD  38.86 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0566283 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.03 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  35.71 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.73 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.87 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  34.17 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  34.17 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  34.17 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  34.17 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  34.17 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0799  hypothetical protein  38.03 
 
 		 210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000364297 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  34.17 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.05 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  34.02 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.62 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  32.24 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  33.33 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  32.68 
 
 		 276 aa  131  9e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  32.24 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  33.33 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  30.62 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  32.64 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  33.33 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  33.47 
 
 		 479 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  33.06 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  34.45 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  32.51 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  34.04 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.75 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.93 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  31.4 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  32.1 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  32.1 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  32.1 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  32.1 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  32.1 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.38 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.07 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  33.33 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  35.75 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  33.33 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.47 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.93 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  33.05 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  32.92 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0990  hypothetical protein  34.07 
 
 		 506 aa  122  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  32.92 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2557  formate dehydrogenase accessory protein  32.7 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.56 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.9 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.71 
 
 		 297 aa  121  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.43 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.71 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.71 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.46 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.04 
 
 		 468 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.06 
 
 		 487 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.04 
 
 		 468 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1125  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.26 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.05 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5379  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.99 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.99 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  30 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  31.62 
 
 		 478 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.96 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4562  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.74 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  31.56 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  31.8 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.66 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4089  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.28 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4425  formate dehydrogenase accessory protein  31.28 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4123  formate dehydrogenase accessory protein  31.28 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.86 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5346  formate dehydrogenase accessory protein  31.28 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4374  formate dehydrogenase accessory protein  31.28 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4122  formate dehydrogenase accessory protein  31.28 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03780  formate dehydrogenase accessory protein  31.2 
 
 		 277 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1352  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.08 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1654  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.08 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03729  hypothetical protein  31.2 
 
 		 277 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4282  formate dehydrogenase accessory protein  30.99 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4365  formate dehydrogenase accessory protein  31.56 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2852  formate dehydrogenase accessory protein  31.37 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  31.8 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.41 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4319  formate dehydrogenase accessory protein  31.4 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.917498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  31.17 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  31.42 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  31.64 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1858  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.98 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4252  formate dehydrogenase accessory protein  31.4 
 
 		 278 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2742  formate dehydrogenase accessory protein  30.8 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.455642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4274  formate dehydrogenase accessory protein  31.4 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>