More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1858 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1858  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 285 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  55.21 
 
 		 295 aa  279  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  51.82 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  54.13 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.663186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3460  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  51.04 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3588  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.21 
 
 		 291 aa  224  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.21 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  0.14649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2355  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  53.11 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  52.48 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.51 
 
 		 272 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1471  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.42 
 
 		 261 aa  218  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0194722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  47.5 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4562  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.37 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  50.62 
 
 		 276 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0723  formate dehydrogenase accessory protein  51.64 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  48.15 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  47.92 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.33 
 
 		 278 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1125  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  51.05 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  51.03 
 
 		 275 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0073  formate dehydrogenase accessory protein  47.7 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0057  formate dehydrogenase accessory protein  47.92 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  45.8 
 
 		 272 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  39.02 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0838  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.52 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0377992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1517  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.15 
 
 		 310 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0766825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4159  formate dehydrogenase accessory protein  47.08 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4441  formate dehydrogenase accessory protein  46.67 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.58 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  47.11 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.83 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4096  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.89 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0082  formate dehydrogenase accessory protein  44.35 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2747  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.99 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2896  formate dehydrogenase accessory protein  48.76 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4953  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.2 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211752  hitchhiker  0.000061887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.17 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  48.96 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  44.49 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2059  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  38.65 
 
 		 277 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03780  formate dehydrogenase accessory protein  43.57 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03729  hypothetical protein  43.57 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3771  formate dehydrogenase accessory protein  44.58 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4089  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.57 
 
 		 277 aa  188  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4252  formate dehydrogenase accessory protein  44.77 
 
 		 278 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4122  formate dehydrogenase accessory protein  43.57 
 
 		 277 aa  188  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5346  formate dehydrogenase accessory protein  43.57 
 
 		 277 aa  188  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4120  formate dehydrogenase accessory protein  44.58 
 
 		 274 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4430  formate dehydrogenase accessory protein  44.77 
 
 		 278 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.141571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4274  formate dehydrogenase accessory protein  44.77 
 
 		 278 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  47.11 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4425  formate dehydrogenase accessory protein  43.57 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4123  formate dehydrogenase accessory protein  43.57 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4374  formate dehydrogenase accessory protein  43.57 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0036  formate dehydrogenase accessory protein  44.58 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3924  formate dehydrogenase accessory protein  48.79 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0389  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.46 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4083  formate dehydrogenase accessory protein  44.77 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0257  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.04 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0282  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.63 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4319  formate dehydrogenase accessory protein  44.35 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.917498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4282  formate dehydrogenase accessory protein  43.93 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2685  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.69 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4365  formate dehydrogenase accessory protein  44.35 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0272  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.04 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03800  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.03 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  46.69 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6044  formate dehydrogenase, subunit FdhD  44.54 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2557  formate dehydrogenase accessory protein  44.66 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2105  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.54 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.54 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.135991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2717  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.54 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1609  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.93 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.54 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2635  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.7 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5399  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.06 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286085  normal  0.067336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2769  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.7 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1423  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.68 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2852  formate dehydrogenase accessory protein  49.79 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5686  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.98 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  0.185398 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.68 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.678396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0201  formate dehydrogenase accessory protein  40.23 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0863  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.23 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2414  formate dehydrogenase accessory protein  40.23 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2744  formate dehydrogenase accessory protein  40.23 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0684  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  40.23 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.3 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.20274  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0699  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  40.23 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2334  formate dehydrogenase accessory protein  40.23 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390052  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  37.9 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6444  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.95 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.57 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3657  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.81 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2742  formate dehydrogenase accessory protein  48.96 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.455642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0569  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.85 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1081  formate dehydrogenase accessory protein  48.55 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0188  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.43 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1050  formate dehydrogenase associated protein  44.77 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0280  formate dehydrogenase, subunit FdhD  40.65 
 
 		 279 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6967  formate dehydrogenase, subunit FdhD  39.54 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>