More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06930 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 297 aa  607  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.68 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  43.09 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.86 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  40.38 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  42.34 
 
 		 268 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.56 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  41.94 
 
 		 268 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  41.94 
 
 		 268 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  42.34 
 
 		 268 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  42.34 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  42.34 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  42.34 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  42.34 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  42.34 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  42.34 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  40.38 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  40.53 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  40.53 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  40.38 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  39.08 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  40.53 
 
 		 265 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  40.15 
 
 		 265 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  39.77 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.48 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  39.77 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  40.49 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  40.49 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  38.98 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.6 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  37.7 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  40.36 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.77 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2010  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.86 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.068526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.63 
 
 		 266 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  32.14 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.2 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.56 
 
 		 487 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.78 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.5 
 
 		 260 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.74 
 
 		 479 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.43 
 
 		 483 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  29.85 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.28 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.06 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.55 
 
 		 468 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.85 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.55 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.71 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1126  formate dehydrogenase accessory protein  28.42 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  32.95 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003500  formate dehydrogenase chain D  28.29 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0152  formate dehydrogenase subunit FdhD  33.61 
 
 		 228 aa  119  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1325  formate dehydrogenase  33.71 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2990  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.58 
 
 		 255 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68227e-19 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 254 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02271  hypothetical protein  29.2 
 
 		 276 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  26.74 
 
 		 260 aa  116  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  27.82 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  27.82 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.03 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.29 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0343  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.4 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00229888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.29 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3910  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  28.4 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  29.87 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2176  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.15 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60851  normal  0.0520829 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3132  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.2 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2580  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.25 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  0.264505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.54 
 
 		 255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3714  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.525322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  31.8 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0300  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.53 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0239  formate dehydrogenase subunit FdhD  28.8 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3785  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.06 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0292467  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3715  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.63 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351414  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.6 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2756  formate dehydrogenase subunit FdhD  30.31 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000145311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4100  formate dehydrogenase subunit FdhD  28.8 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4218  formate dehydrogenase subunit FdhD  28.8 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072328  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  32.53 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4130  formate dehydrogenase subunit FdhD  28.8 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.142791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0051  formate dehydrogenase, subunit FdhD  29.92 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  29.77 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.89 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.85 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158751 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0053  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.06 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0723  formate dehydrogenase accessory protein  33.89 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4143  formate dehydrogenase subunit FdhD  27.27 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.31 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.34 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.76 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4427  formate dehydrogenase, subunit FdhD  26.09 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2367  FDHD protein  30.04 
 
 		 291 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0478854 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.15 
 
 		 254 aa  106  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  32 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.29 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1448  putative formate dehydrogenase accessory protein  26.89 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.02 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2557  formate dehydrogenase accessory protein  32.37 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>