More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1911 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0990  hypothetical protein  44.16 
 
 		 506 aa  201  8e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0358  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.46 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0479  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.92 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.161878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1440  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.21 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0547  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.84 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1248  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.7 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1386  fdhD protein  39.29 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.2 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.71 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.948078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0280  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.717981  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  31.84 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.56 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  31.87 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.05 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.48 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.01 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.22 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  32.66 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.46 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.78 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0152  formate dehydrogenase subunit FdhD  32.59 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.73 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  30.68 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  30.68 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.74 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  29.76 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.9 
 
 		 483 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  32.2 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1258  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.65 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2990  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.76 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68227e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  31.28 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.88 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  28.97 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  28.97 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  30.65 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.34 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  30.83 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  30.12 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  30.12 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  28.97 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  30.12 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  30.12 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.32 
 
 		 468 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  30.12 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  29.27 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  32.37 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.32 
 
 		 468 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2010  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.08 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.068526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.47 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  30.42 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  27.6 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  27.6 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  28.97 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  30 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30.93 
 
 		 479 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.67 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.78 
 
 		 487 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.17 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  30.42 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.42 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  30.42 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.51 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  34.02 
 
 		 478 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  27.09 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.18 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32 
 
 		 264 aa  98.6  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.36 
 
 		 283 aa  98.6  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.39 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  29.82 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.56 
 
 		 281 aa  97.1  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.94 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.503102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.8 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2431  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.03 
 
 		 297 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.61 
 
 		 284 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.79 
 
 		 290 aa  92.4  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.559455 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1352  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.45 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.11 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1654  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.45 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  29.06 
 
 		 269 aa  91.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  28.4 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  29.17 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  30.92 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1042  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.57 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.44 
 
 		 297 aa  88.6  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  29.08 
 
 		 278 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  33.18 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2410  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.55 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.038103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.3 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  29.03 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  29.03 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.54 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5485  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.33 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3132  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.82 
 
 		 296 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1325  formate dehydrogenase  45.05 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201918 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  26.58 
 
 		 265 aa  85.5  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  26.58 
 
 		 265 aa  85.5  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.98 
 
 		 293 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2852  formate dehydrogenase accessory protein  31.3 
 
 		 271 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  0.675793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>