More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2410 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2410  formate dehydrogenase subunit FdhD  100 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.038103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1232  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  41.47 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0303539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0707  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  43.04 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2374  formate dehydrogenase, subunit FdhD  38.71 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.65 
 
 		 281 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.503102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.44 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2010  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.74 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.068526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.7 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.17 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.36 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3467  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.22 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.73 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1325  formate dehydrogenase  35.56 
 
 		 282 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.1 
 
 		 283 aa  95.9  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0667  formate dehydrogenase, subunit FdhD  43.4 
 
 		 320 aa  95.9  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187577  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  31.17 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.03 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  41.22 
 
 		 287 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  40.29 
 
 		 278 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  43.12 
 
 		 279 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  40.69 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  40.69 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3645  formate dehydrogenase accessory protein  40.69 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.78 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.78 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.17 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0919  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.05 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  30.52 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0152  formate dehydrogenase subunit FdhD  29.02 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189398  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  25.31 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0990  hypothetical protein  30.09 
 
 		 506 aa  92  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  23.64 
 
 		 265 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.88 
 
 		 297 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  35.29 
 
 		 479 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0802  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40 
 
 		 309 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  24.39 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  29.87 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  30.07 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.89 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  21.96 
 
 		 265 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  21.96 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1081  formate dehydrogenase accessory protein  44.83 
 
 		 271 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  21.96 
 
 		 265 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  21.57 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0479  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.54 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.161878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1914  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.1 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.84446  hitchhiker  0.0000450272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  27.2 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.5 
 
 		 275 aa  89  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  21.57 
 
 		 265 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  29.22 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  29.22 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  29.22 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  29.22 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.05 
 
 		 262 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0358  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  25.62 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  30.63 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  24.8 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  29.38 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  24.8 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  30 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2742  formate dehydrogenase accessory protein  44.83 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.455642 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.55 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.93 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0300  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.76 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2306  formate dehydrogenase accessory protein  44.33 
 
 		 286 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  28.57 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.21 
 
 		 468 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1440  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.54 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.21 
 
 		 468 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4096  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.8 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.21 
 
 		 487 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.72 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.78 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.32 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29960  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.24 
 
 		 290 aa  85.1  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3756  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.43 
 
 		 293 aa  85.1  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  41.28 
 
 		 274 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  20.78 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  37.12 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.52 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.93 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  29.68 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1624  formate dehydrogenase accessory protein  37.31 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199677  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4274  formate dehydrogenase accessory protein  29.57 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4252  formate dehydrogenase accessory protein  29.77 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4430  formate dehydrogenase accessory protein  29.57 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.141571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.51 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3132  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.83 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  30.32 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.27 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.75 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.87 
 
 		 478 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5485  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.02 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  25.2 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.68 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0335  formate dehydrogenase, subunit FdhD  45.28 
 
 		 379 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.727751  hitchhiker  0.00000000798764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.88 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.61 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190286  normal  0.450468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>