More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0990 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0990  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1037    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.16 
 
 		 249 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0358  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.66 
 
 		 233 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0479  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.33 
 
 		 233 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.161878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0547  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.55 
 
 		 237 aa  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1440  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.34 
 
 		 233 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.92 
 
 		 261 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.95 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.4 
 
 		 254 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.07 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1248  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.48 
 
 		 249 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.66 
 
 		 260 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.12 
 
 		 254 aa  113  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  29.17 
 
 		 269 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  28.46 
 
 		 265 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  28.46 
 
 		 265 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  29.48 
 
 		 265 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  29.48 
 
 		 265 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  28.46 
 
 		 265 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2010  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.05 
 
 		 248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.068526  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.02 
 
 		 260 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.948078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  31.2 
 
 		 268 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  31.73 
 
 		 263 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  28.08 
 
 		 265 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  28.08 
 
 		 265 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  28.52 
 
 		 265 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.86 
 
 		 303 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  28.08 
 
 		 265 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.56 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  27.65 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  28.08 
 
 		 265 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.33 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  27.82 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  27.65 
 
 		 268 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  27.65 
 
 		 268 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  27.65 
 
 		 268 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  27.65 
 
 		 268 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  27.65 
 
 		 268 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.06 
 
 		 255 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  28.08 
 
 		 268 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  28.68 
 
 		 268 aa  107  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  28.79 
 
 		 268 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  29.76 
 
 		 276 aa  107  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.33 
 
 		 255 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  29.57 
 
 		 260 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.49 
 
 		 255 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  29.57 
 
 		 260 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0280  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.77 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.717981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  40.62 
 
 		 279 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28 
 
 		 266 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.56 
 
 		 238 aa  105  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0152  formate dehydrogenase subunit FdhD  30.84 
 
 		 228 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189398  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.95 
 
 		 281 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.503102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  27.71 
 
 		 263 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.42 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  34.18 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.65 
 
 		 283 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.57 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  28.74 
 
 		 260 aa  100  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.2 
 
 		 284 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.91 
 
 		 297 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.05 
 
 		 483 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1325  formate dehydrogenase  39.26 
 
 		 282 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201918 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1258  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.89 
 
 		 224 aa  97.1  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.41 
 
 		 262 aa  96.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1386  fdhD protein  29.75 
 
 		 257 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0648  formate dehydrogenase, subunit FdhD  29.38 
 
 		 276 aa  95.5  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  30.98 
 
 		 278 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  30.98 
 
 		 278 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  27.02 
 
 		 262 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1654  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.52 
 
 		 282 aa  94.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1352  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.52 
 
 		 282 aa  94.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.2 
 
 		 274 aa  94.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  31.22 
 
 		 479 aa  94  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  30.98 
 
 		 278 aa  94  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  30.98 
 
 		 278 aa  93.6  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  31.95 
 
 		 278 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.42 
 
 		 251 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  29.27 
 
 		 260 aa  92.8  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  30.83 
 
 		 278 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  30.83 
 
 		 278 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  30.83 
 
 		 278 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  29.67 
 
 		 273 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2410  formate dehydrogenase subunit FdhD  30.09 
 
 		 240 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.038103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.44 
 
 		 258 aa  91.3  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1914  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.41 
 
 		 285 aa  91.3  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.84446  hitchhiker  0.0000450272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.5 
 
 		 284 aa  90.9  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.07 
 
 		 293 aa  90.1  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  28.22 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.17 
 
 		 260 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  39.04 
 
 		 276 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.74 
 
 		 278 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3132  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.36 
 
 		 296 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2431  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.07 
 
 		 297 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.75 
 
 		 299 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.68 
 
 		 296 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158751 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.74 
 
 		 289 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  38.62 
 
 		 287 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  28.06 
 
 		 272 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.91 
 
 		 299 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>