More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1343 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  66.92 
 
 		 262 aa  380  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  52.73 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  53.33 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  52.73 
 
 		 265 aa  284  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  52.94 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  52.94 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  52.16 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  52.73 
 
 		 265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  52.16 
 
 		 265 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  52.96 
 
 		 265 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  52.96 
 
 		 265 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  50.4 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.58 
 
 		 280 aa  265  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  49.21 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  48.08 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  48.81 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  49.21 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  49.21 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  49.21 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  49.21 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  48.85 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  49.21 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  49.21 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  53.18 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.63 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.7 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.76 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.09 
 
 		 297 aa  208  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  42 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.13 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.36 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  37.9 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.36 
 
 		 483 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.13 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.6 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.121584  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.72 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.57 
 
 		 487 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.72 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.88 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.8 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  33.47 
 
 		 479 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.72 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  33.6 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.34 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  34.4 
 
 		 478 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.44 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4473  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.75 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.979472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2990  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.81 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68227e-19 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.68 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.6 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.73 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0723  formate dehydrogenase accessory protein  33.21 
 
 		 277 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.08 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.43 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.6 
 
 		 468 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  36.69 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.11 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.6 
 
 		 468 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4073  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.77 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.4 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  35.74 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  35.74 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.11 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3645  formate dehydrogenase accessory protein  35.74 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  34.89 
 
 		 279 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1624  formate dehydrogenase accessory protein  36.92 
 
 		 275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  34.26 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.91 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.503102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0300  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.09 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  33.33 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  36.02 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.02 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.9 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.87 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.25 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  30.15 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1914  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.98 
 
 		 285 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.84446  hitchhiker  0.0000450272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2010  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.83 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.068526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.46 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  31.91 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.72 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.96 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.87 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.55 
 
 		 289 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.47 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  29.64 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  34.31 
 
 		 275 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  32.69 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  31.35 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3657  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.21 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3467  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.11 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  29.92 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.05 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1325  formate dehydrogenase  33.33 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.2 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0877  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.09 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3924  formate dehydrogenase accessory protein  31.82 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  31.92 
 
 		 281 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>