More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2876 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 262 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  56 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.4 
 
 		 266 aa  238  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  44.57 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  42.02 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  42.41 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  42.41 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  42.41 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  42.41 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  41.63 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.68 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  42.08 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  42.41 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  41.7 
 
 		 268 aa  228  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  42.13 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  43.31 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  42.91 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  42.75 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  41.7 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  42.52 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  42.52 
 
 		 265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  42.35 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  42.52 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  43.39 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  43.57 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  42.06 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  42.06 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  44.96 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  38 
 
 		 268 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  42.27 
 
 		 223 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1923  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.85 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.53 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.88 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.18 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.7 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  36.26 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2010  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.29 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.068526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3715  formate dehydrogenase subunit FdhD  35.2 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.4 
 
 		 483 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.13 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.07 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.2 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.77 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.08 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.47 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02271  hypothetical protein  35.86 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1126  formate dehydrogenase accessory protein  33.87 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  33.46 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  33.46 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0343  formate dehydrogenase, subunit FdhD  34.76 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00229888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003500  formate dehydrogenase chain D  34.82 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.78 
 
 		 468 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.78 
 
 		 468 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35 
 
 		 487 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  32.81 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.6 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.59 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  34.96 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1448  putative formate dehydrogenase accessory protein  33.2 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.11 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2990  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68227e-19 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4143  formate dehydrogenase subunit FdhD  32.2 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0687  formate dehydrogenase, subunit FdhD  34.05 
 
 		 276 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0053  formate dehydrogenase, subunit FdhD  32.63 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.85 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4819  formate dehydrogenase subunit FdhD  32.64 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4473  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.16 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.979472  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.27 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3910  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  33.05 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  32.33 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3714  formate dehydrogenase, subunit FdhD  32.62 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.525322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2367  FDHD protein  34.6 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0478854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  32.09 
 
 		 279 aa  138  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.11 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4218  formate dehydrogenase subunit FdhD  33.48 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.072328  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4100  formate dehydrogenase subunit FdhD  33.48 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4503  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  32.19 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4130  formate dehydrogenase subunit FdhD  33.48 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.142791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2756  formate dehydrogenase subunit FdhD  33.62 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000145311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0051  formate dehydrogenase, subunit FdhD  29.92 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0239  formate dehydrogenase subunit FdhD  33.48 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4427  formate dehydrogenase, subunit FdhD  32.1 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2431  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.33 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3785  formate dehydrogenase, subunit FdhD  32.62 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0292467  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2580  formate dehydrogenase subunit FdhD  34.04 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  0.264505 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5485  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.52 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2176  formate dehydrogenase subunit FdhD  34.04 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60851  normal  0.0520829 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.94 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1909  formate dehydrogenase, subunit FdhD  33.06 
 
 		 300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3132  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.62 
 
 		 296 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.36 
 
 		 284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.32 
 
 		 283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0648  formate dehydrogenase, subunit FdhD  32.22 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 478 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.95 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.38 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3256  formate dehydrogenase, subunit FdhD  32.07 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.340615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  33.71 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.58 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  33.71 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>