More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2665 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 275 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4073  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.91 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  51.45 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.1 
 
 		 299 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  51.33 
 
 		 274 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.75 
 
 		 299 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.92 
 
 		 284 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  52.71 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  51.94 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1325  formate dehydrogenase  48.84 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.38 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.23 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4473  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  52.12 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.979472  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.82 
 
 		 281 aa  241  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.62 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  48.71 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.81 
 
 		 281 aa  238  6.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.503102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  48.93 
 
 		 279 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1914  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.89 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.84446  hitchhiker  0.0000450272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  49.62 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  48.92 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  48.92 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3645  formate dehydrogenase accessory protein  48.92 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  47.19 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0802  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.28 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1624  formate dehydrogenase accessory protein  47.49 
 
 		 275 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.85 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2306  formate dehydrogenase accessory protein  47.01 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.85 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.04 
 
 		 273 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0919  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.04 
 
 		 292 aa  221  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.38 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0300  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.96 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.8 
 
 		 297 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.69 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3467  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.02 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5379  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.06 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1335  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.55 
 
 		 289 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000543766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.87 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.121584  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29960  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.2 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.57 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197477 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.5 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0667  formate dehydrogenase, subunit FdhD  53.89 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.81 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2123  formate dehydrogenase, subunit FdhD  38.43 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  hitchhiker  0.00982991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.9 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.255284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2698  formate dehydrogenase, subunit FdhD  42.8 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0902014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.56 
 
 		 288 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0877  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.56 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0826  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.66 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.23 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190286  normal  0.450468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2845  formate dehydrogenase, subunit FdhD  34.39 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3047  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.69 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.83 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.96 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3516  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.85 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  34.77 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.58 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  34.82 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.05 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  36.09 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  35.84 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1537  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.29 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000559479  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  32 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  30.53 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  33.46 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  33.46 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  33.46 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  33.46 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  33.86 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  33.93 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.86 
 
 		 274 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.94 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  30.53 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  30.53 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  35.74 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0699  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.45 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  30.15 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  33.07 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2334  formate dehydrogenase accessory protein  33.57 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  30.15 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0201  formate dehydrogenase accessory protein  33.57 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  34.15 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0863  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.57 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  33.46 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  30.15 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2414  formate dehydrogenase accessory protein  33.57 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2744  formate dehydrogenase accessory protein  33.57 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0684  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.57 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.75 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  32.56 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0389  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.55 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  31.52 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  30.15 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  29.77 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.02 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0159111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.49 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  33.07 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3460  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.16 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1639  formate dehydrogenase accessory protein  32.31 
 
 		 223 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>