More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2698 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2698  formate dehydrogenase, subunit FdhD  100 
 
 		 283 aa  560  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0902014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1325  formate dehydrogenase  52.33 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.74 
 
 		 299 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.74 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.34 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1914  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.93 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.84446  hitchhiker  0.0000450272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.07 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.26 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.69 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.29 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.28 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.04 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4473  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.4 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.979472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1624  formate dehydrogenase accessory protein  47.97 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0802  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.23 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0919  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.23 
 
 		 292 aa  188  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.53 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1335  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.35 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000543766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3467  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.7 
 
 		 294 aa  185  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  48.21 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  47.06 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  47.06 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3645  formate dehydrogenase accessory protein  47.06 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.32 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0300  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.21 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  46.83 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.53 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.121584  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  47.74 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.21 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.503102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.01 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  43.68 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.7 
 
 		 288 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.82 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.8 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2306  formate dehydrogenase accessory protein  48.68 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4073  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29960  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.15 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.41 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.68 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.255284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.74 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5379  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.35 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.08 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.37 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.63 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2123  formate dehydrogenase, subunit FdhD  39.76 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  hitchhiker  0.00982991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2845  formate dehydrogenase, subunit FdhD  38.43 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0667  formate dehydrogenase, subunit FdhD  37.38 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0877  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.89 
 
 		 288 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.58 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0826  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.97 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3047  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.06 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.71 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  35.42 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0834  formate dehydrogenase subunit FdhD  37.35 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2059  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  34.54 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  42.58 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  32.71 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1537  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.15 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000559479  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  34.92 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.64 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.71 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190286  normal  0.450468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2355  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.69 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  32.38 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.54 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4953  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.67 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211752  hitchhiker  0.000061887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03800  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.23 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.96 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.67 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3588  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.98 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.5 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  0.14649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  31.91 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0282  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.96 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0280  formate dehydrogenase, subunit FdhD  41.67 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1125  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.21 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2148  formate dehydrogenase, subunit FdhD  39.22 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3460  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.5 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0272  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.28 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  28.94 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0257  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.28 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  28.94 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  28.94 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  28.94 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  28.94 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3012  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.32 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.49 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3516  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.07 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  28.78 
 
 		 268 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1517  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.51 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0766825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  28.63 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  28.41 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  28.57 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2742  formate dehydrogenase accessory protein  32.73 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.455642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1471  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.88 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0194722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  37.5 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68430  putative formate dehydrogenase accessory protein FdhD  41.26 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.270823  normal  0.596134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.94 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  28.57 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.41 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>