More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2148 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2148  formate dehydrogenase, subunit FdhD  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5920  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  69.85 
 
 		 279 aa  362  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68430  putative formate dehydrogenase accessory protein FdhD  69.08 
 
 		 279 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.270823  normal  0.596134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0391  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  66.03 
 
 		 274 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000093  formate dehydrogenase chain D  58.39 
 
 		 276 aa  326  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03800  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  61.85 
 
 		 275 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0282  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  59.02 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4953  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  59.4 
 
 		 276 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211752  hitchhiker  0.000061887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0257  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  58.65 
 
 		 276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0272  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  58.65 
 
 		 276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5406  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  57.03 
 
 		 278 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4945  formate dehydrogenase, subunit FdhD  56.32 
 
 		 278 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0280  formate dehydrogenase, subunit FdhD  57.09 
 
 		 279 aa  298  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0748  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.15 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.27 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3012  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.49 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  38.79 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2059  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  43.05 
 
 		 277 aa  182  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.22 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.78 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  40.35 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  37.96 
 
 		 283 aa  168  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.41 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3869  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.84 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1125  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.26 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2747  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.61 
 
 		 292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  43.28 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  38.02 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  39.57 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.67 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4096  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.45 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0838  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.77 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0377992  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.23 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.96 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  32.05 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2635  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.75 
 
 		 274 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2769  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.33 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  38.43 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6044  formate dehydrogenase, subunit FdhD  38.75 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1858  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.03 
 
 		 285 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2685  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.89 
 
 		 269 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1423  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.84 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.84 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.678396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  35.89 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  36.75 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.84 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.20274  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  37.61 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0389  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.89 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  37.61 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  37.18 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  36.55 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0569  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.96 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  36.32 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.92 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.135991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2105  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.92 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2717  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.92 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0699  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  39.3 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5399  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.84 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286085  normal  0.067336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0201  formate dehydrogenase accessory protein  39.3 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0863  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.3 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3924  formate dehydrogenase accessory protein  37.08 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0684  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  39.3 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2334  formate dehydrogenase accessory protein  39.3 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2414  formate dehydrogenase accessory protein  39.3 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2744  formate dehydrogenase accessory protein  39.3 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6444  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.84 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  36.32 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1609  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.74 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0082  formate dehydrogenase accessory protein  34.62 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0036  formate dehydrogenase accessory protein  36.67 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.36 
 
 		 274 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4034  formate dehydrogenase, subunit FdhD  38.79 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5686  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.64 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  0.185398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.7 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3771  formate dehydrogenase accessory protein  36.25 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4120  formate dehydrogenase accessory protein  36.25 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2557  formate dehydrogenase accessory protein  39.65 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0057  formate dehydrogenase accessory protein  37.3 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  35.8 
 
 		 272 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1050  formate dehydrogenase associated protein  37.61 
 
 		 273 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4083  formate dehydrogenase accessory protein  35.83 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4388  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.01 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  0.955368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3460  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.1 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2355  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.04 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4278  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.01 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  35.47 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1471  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.12 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0194722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  35.54 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3588  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.36 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.48 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.36 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  0.14649 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6967  formate dehydrogenase, subunit FdhD  36.49 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.44 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.663186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4123  formate dehydrogenase accessory protein  35.42 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4425  formate dehydrogenase accessory protein  35.42 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  36.67 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0073  formate dehydrogenase accessory protein  35.04 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4374  formate dehydrogenase accessory protein  35.42 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4441  formate dehydrogenase accessory protein  37.72 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5346  formate dehydrogenase accessory protein  35.42 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>