More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0838 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0838  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 275 aa  544  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0377992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  54.04 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  53.73 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  55.29 
 
 		 278 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  54.88 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0723  formate dehydrogenase accessory protein  52.09 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  50.74 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3924  formate dehydrogenase accessory protein  51.33 
 
 		 274 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.63 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4096  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.68 
 
 		 274 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3657  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  54.23 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2896  formate dehydrogenase accessory protein  51.16 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  44.78 
 
 		 269 aa  235  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2852  formate dehydrogenase accessory protein  50.19 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2742  formate dehydrogenase accessory protein  49.81 
 
 		 271 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.455642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1081  formate dehydrogenase accessory protein  49.43 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2557  formate dehydrogenase accessory protein  46.56 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  45.59 
 
 		 288 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.19 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.87 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.76 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  43.19 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  45.45 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1858  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.52 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.67 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2747  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.01 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.76 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.82 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.98 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  42.97 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2685  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.26 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  42.74 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2355  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.14 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3588  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.07 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.32 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  0.14649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1609  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.47 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.46 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.663186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2059  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  37.99 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1471  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.5 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0194722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3460  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.2 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1050  formate dehydrogenase associated protein  42.92 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4278  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.61 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4388  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.61 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  0.955368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4562  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.81 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2744  formate dehydrogenase accessory protein  39.92 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0201  formate dehydrogenase accessory protein  39.92 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0863  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.92 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2334  formate dehydrogenase accessory protein  39.92 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2414  formate dehydrogenase accessory protein  39.92 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0684  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  39.92 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0699  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  39.92 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2635  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.41 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1125  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.62 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0188  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.17 
 
 		 267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2769  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.41 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0569  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.92 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0737  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.42 
 
 		 264 aa  161  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.22 
 
 		 289 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.20274  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5399  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.86 
 
 		 284 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286085  normal  0.067336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1423  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.22 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6444  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.4 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.22 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.678396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.66 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0082  formate dehydrogenase accessory protein  36.08 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5686  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.98 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  0.185398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0073  formate dehydrogenase accessory protein  38.49 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6044  formate dehydrogenase, subunit FdhD  39.59 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6967  formate dehydrogenase, subunit FdhD  43.4 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03800  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.23 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0389  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.55 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.318407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03780  formate dehydrogenase accessory protein  35.83 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4089  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.83 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  34.88 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4122  formate dehydrogenase accessory protein  35.83 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2148  formate dehydrogenase, subunit FdhD  40.53 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4282  formate dehydrogenase accessory protein  35.83 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03729  hypothetical protein  35.83 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5346  formate dehydrogenase accessory protein  35.83 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4123  formate dehydrogenase accessory protein  35.83 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4425  formate dehydrogenase accessory protein  35.83 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4374  formate dehydrogenase accessory protein  35.83 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.18 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.135991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2105  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.18 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.08 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2717  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.18 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0280  formate dehydrogenase, subunit FdhD  35.74 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5920  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.63 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000093  formate dehydrogenase chain D  36.36 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4953  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.82 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211752  hitchhiker  0.000061887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4034  formate dehydrogenase, subunit FdhD  39.6 
 
 		 279 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0036  formate dehydrogenase accessory protein  38.24 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  38.31 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3771  formate dehydrogenase accessory protein  37.82 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0282  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.55 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68430  putative formate dehydrogenase accessory protein FdhD  37.5 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.270823  normal  0.596134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4120  formate dehydrogenase accessory protein  37.82 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0057  formate dehydrogenase accessory protein  37.13 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0391  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.69 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4441  formate dehydrogenase accessory protein  37.04 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>