More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0389 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0389  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 273 aa  554  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  86.13 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4034  formate dehydrogenase, subunit FdhD  85.77 
 
 		 279 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0699  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  79.49 
 
 		 274 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2334  formate dehydrogenase accessory protein  79.12 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0201  formate dehydrogenase accessory protein  79.12 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0863  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  79.12 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2414  formate dehydrogenase accessory protein  79.12 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2744  formate dehydrogenase accessory protein  79.12 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0684  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  79.12 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0569  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  78.75 
 
 		 274 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2769  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  79.12 
 
 		 274 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2635  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  79.12 
 
 		 274 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  77.66 
 
 		 274 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6044  formate dehydrogenase, subunit FdhD  77.26 
 
 		 278 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  80.45 
 
 		 284 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.135991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2105  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  80.45 
 
 		 284 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2717  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  80.45 
 
 		 284 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  60.38 
 
 		 290 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  66.54 
 
 		 289 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.20274  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1423  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  66.54 
 
 		 289 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  66.54 
 
 		 289 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.678396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6967  formate dehydrogenase, subunit FdhD  63.78 
 
 		 289 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5399  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  63.06 
 
 		 284 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286085  normal  0.067336 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5686  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  64.57 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  0.185398 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6444  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  65.75 
 
 		 290 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1125  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  56.55 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3826  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  54.03 
 
 		 313 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.145435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1050  formate dehydrogenase associated protein  48.5 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.06 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.19 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  46.54 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1517  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.27 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0766825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4388  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.77 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  0.955368 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4278  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.77 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.79 
 
 		 277 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  41.85 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  44.92 
 
 		 288 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  43.17 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  44.53 
 
 		 281 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.17 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  42.7 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2747  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.69 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4083  formate dehydrogenase accessory protein  41.64 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0082  formate dehydrogenase accessory protein  45.11 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5346  formate dehydrogenase accessory protein  43.59 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4089  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.74 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4122  formate dehydrogenase accessory protein  42.74 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03780  formate dehydrogenase accessory protein  42.74 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4374  formate dehydrogenase accessory protein  42.74 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4123  formate dehydrogenase accessory protein  42.74 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4282  formate dehydrogenase accessory protein  42.74 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4425  formate dehydrogenase accessory protein  42.74 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03729  hypothetical protein  42.74 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4430  formate dehydrogenase accessory protein  42.32 
 
 		 278 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.141571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4274  formate dehydrogenase accessory protein  42.32 
 
 		 278 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4365  formate dehydrogenase accessory protein  42.21 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4252  formate dehydrogenase accessory protein  42.32 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4319  formate dehydrogenase accessory protein  42.32 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.917498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2059  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  40.73 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.8 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  39.62 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  39.23 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0073  formate dehydrogenase accessory protein  41.11 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  39.62 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2685  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.93 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  40 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1471  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.83 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0194722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0057  formate dehydrogenase accessory protein  39.78 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4441  formate dehydrogenase accessory protein  41.74 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1858  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.46 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4159  formate dehydrogenase accessory protein  41.39 
 
 		 277 aa  175  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  40.16 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  40.16 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000093  formate dehydrogenase chain D  40.83 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  39.76 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.8 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3771  formate dehydrogenase accessory protein  40.62 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  38.52 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4120  formate dehydrogenase accessory protein  40.62 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0036  formate dehydrogenase accessory protein  40.62 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0723  formate dehydrogenase accessory protein  39.08 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  40.08 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  40.68 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.32 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.95 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.663186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0257  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.49 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2355  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.08 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0280  formate dehydrogenase, subunit FdhD  36.73 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0188  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.13 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0391  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.66 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.8 
 
 		 299 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0272  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.66 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0838  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.55 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0377992  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0282  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.24 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.5 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03800  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.25 
 
 		 275 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  37.97 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4953  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.24 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211752  hitchhiker  0.000061887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3588  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.75 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>