More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3869 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3869  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 263 aa  538  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  44.14 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0391  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.09 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000093  formate dehydrogenase chain D  40 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5920  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.96 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  40.09 
 
 		 288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68430  putative formate dehydrogenase accessory protein FdhD  39.6 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.270823  normal  0.596134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03800  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.56 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  42.79 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4953  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.38 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211752  hitchhiker  0.000061887 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1125  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.24 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  39.13 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2148  formate dehydrogenase, subunit FdhD  41.63 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0723  formate dehydrogenase accessory protein  42.34 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0280  formate dehydrogenase, subunit FdhD  39.18 
 
 		 279 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4096  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.42 
 
 		 274 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0257  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.94 
 
 		 276 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  38.56 
 
 		 290 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5406  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  37.45 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.74 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  38.74 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  37.02 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.67 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3924  formate dehydrogenase accessory protein  39.74 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4945  formate dehydrogenase, subunit FdhD  38.12 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1050  formate dehydrogenase associated protein  39 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0272  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.5 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0282  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.5 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  39.3 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0699  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  39.66 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.39 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0201  formate dehydrogenase accessory protein  39.66 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0684  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  39.66 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0863  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.66 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2744  formate dehydrogenase accessory protein  39.66 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2414  formate dehydrogenase accessory protein  39.66 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2334  formate dehydrogenase accessory protein  39.66 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390052  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5399  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.83 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286085  normal  0.067336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2059  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  38.43 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  37.34 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1423  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.63 
 
 		 289 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.63 
 
 		 289 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.678396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.63 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.20274  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0569  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.95 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2105  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.56 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.56 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.135991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2717  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.56 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  37.66 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2747  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.34 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059323 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4278  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.86 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4388  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.86 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  0.955368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2635  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.86 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6967  formate dehydrogenase, subunit FdhD  37.77 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4034  formate dehydrogenase, subunit FdhD  39.74 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.8 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0389  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.28 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3826  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.2 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.145435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.29 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2769  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.86 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  38.67 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6044  formate dehydrogenase, subunit FdhD  37.24 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1517  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.45 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0766825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.83 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5686  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.34 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  0.185398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.19 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.82 
 
 		 292 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0748  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.55 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0838  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.39 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0377992  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  35.37 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4441  formate dehydrogenase accessory protein  39.42 
 
 		 277 aa  141  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  38.02 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2896  formate dehydrogenase accessory protein  35.96 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6444  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.91 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03780  formate dehydrogenase accessory protein  35.97 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.33 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03729  hypothetical protein  35.97 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4089  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.82 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4282  formate dehydrogenase accessory protein  39.13 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4122  formate dehydrogenase accessory protein  36.82 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5346  formate dehydrogenase accessory protein  36.82 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4374  formate dehydrogenase accessory protein  39.13 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4123  formate dehydrogenase accessory protein  39.13 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4425  formate dehydrogenase accessory protein  39.13 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.78 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.663186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0082  formate dehydrogenase accessory protein  37.33 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2355  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.8 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0188  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.15 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3588  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.7 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2685  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.96 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  35.56 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  35.56 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  35.56 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4159  formate dehydrogenase accessory protein  37.97 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2852  formate dehydrogenase accessory protein  40.35 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.7 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  0.14649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  37.55 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0036  formate dehydrogenase accessory protein  36.67 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2557  formate dehydrogenase accessory protein  37.34 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3012  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.39 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3460  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.84 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>