More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00469 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  53.28 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  52.94 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.39 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  51.01 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  52.34 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  52.26 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  52.17 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1125  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.58 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  51.89 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0389  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.54 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  45.98 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2635  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.74 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2769  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.74 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.04 
 
 		 279 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.36 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6044  formate dehydrogenase, subunit FdhD  46.74 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.74 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.135991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2105  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.74 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2355  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.96 
 
 		 283 aa  214  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2717  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.74 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0057  formate dehydrogenase accessory protein  45.63 
 
 		 272 aa  214  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0082  formate dehydrogenase accessory protein  42.64 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2747  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.01 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  42.86 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.3 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.20274  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1423  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.3 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.39 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.3 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.678396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0073  formate dehydrogenase accessory protein  45 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.55 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0699  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  45.42 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.52 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.663186 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2414  formate dehydrogenase accessory protein  45.42 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0201  formate dehydrogenase accessory protein  45.42 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0863  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.42 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0684  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  45.42 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2334  formate dehydrogenase accessory protein  45.42 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2744  formate dehydrogenase accessory protein  45.42 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5399  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.92 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286085  normal  0.067336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0036  formate dehydrogenase accessory protein  44.44 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0569  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.8 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3460  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.3 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4120  formate dehydrogenase accessory protein  44.03 
 
 		 274 aa  205  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  42.13 
 
 		 287 aa  204  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3588  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.3 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4159  formate dehydrogenase accessory protein  45.45 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.3 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  0.14649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3771  formate dehydrogenase accessory protein  44.03 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4096  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.35 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1858  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.92 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4034  formate dehydrogenase, subunit FdhD  45.98 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4083  formate dehydrogenase accessory protein  44.44 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4089  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.21 
 
 		 277 aa  202  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4123  formate dehydrogenase accessory protein  44.21 
 
 		 266 aa  201  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4425  formate dehydrogenase accessory protein  44.21 
 
 		 266 aa  201  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5346  formate dehydrogenase accessory protein  44.21 
 
 		 277 aa  202  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4374  formate dehydrogenase accessory protein  44.21 
 
 		 266 aa  201  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4122  formate dehydrogenase accessory protein  44.21 
 
 		 277 aa  202  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4282  formate dehydrogenase accessory protein  44.4 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715148  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03780  formate dehydrogenase accessory protein  44.21 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03729  hypothetical protein  44.21 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4441  formate dehydrogenase accessory protein  43.8 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5686  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.24 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  0.185398 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6967  formate dehydrogenase, subunit FdhD  45.45 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4365  formate dehydrogenase accessory protein  44.4 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4319  formate dehydrogenase accessory protein  44.4 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.917498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4430  formate dehydrogenase accessory protein  44.4 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.141571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4274  formate dehydrogenase accessory protein  44.4 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4252  formate dehydrogenase accessory protein  44.4 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  43.7 
 
 		 276 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2685  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.57 
 
 		 269 aa  199  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1050  formate dehydrogenase associated protein  47.97 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6444  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.62 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  45.9 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  41.86 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1517  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.44 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0766825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0723  formate dehydrogenase accessory protein  44.83 
 
 		 277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0188  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.37 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  41.67 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  41.67 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  44.71 
 
 		 274 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4388  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.22 
 
 		 271 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  0.955368 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4278  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.22 
 
 		 271 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  42.02 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3924  formate dehydrogenase accessory protein  44.62 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  41.41 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  45.71 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0838  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.45 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0377992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  41.41 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  41.02 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2059  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  43.33 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  45.9 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2896  formate dehydrogenase accessory protein  47.64 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1081  formate dehydrogenase accessory protein  46.99 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  44.98 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2742  formate dehydrogenase accessory protein  46.4 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.455642 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000093  formate dehydrogenase chain D  45.19 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4562  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.36 
 
 		 277 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2557  formate dehydrogenase accessory protein  45.61 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>