More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0748 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0748  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  67.63 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0280  formate dehydrogenase, subunit FdhD  48.61 
 
 		 279 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0391  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.52 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4953  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.68 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211752  hitchhiker  0.000061887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0257  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.41 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4945  formate dehydrogenase, subunit FdhD  47.06 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0272  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.41 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0282  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.99 
 
 		 276 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5406  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  46.84 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5920  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.99 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2148  formate dehydrogenase, subunit FdhD  48.67 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68430  putative formate dehydrogenase accessory protein FdhD  46.41 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.270823  normal  0.596134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03800  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.8 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000093  formate dehydrogenase chain D  47.26 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3012  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.63 
 
 		 290 aa  205  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2059  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  37.6 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  37.8 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0082  formate dehydrogenase accessory protein  35.93 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03780  formate dehydrogenase accessory protein  33.88 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03729  hypothetical protein  33.88 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4089  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.88 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4122  formate dehydrogenase accessory protein  33.88 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4425  formate dehydrogenase accessory protein  33.88 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4282  formate dehydrogenase accessory protein  33.88 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4123  formate dehydrogenase accessory protein  33.88 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4374  formate dehydrogenase accessory protein  33.88 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5346  formate dehydrogenase accessory protein  33.88 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1125  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.35 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0036  formate dehydrogenase accessory protein  34.84 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0057  formate dehydrogenase accessory protein  35.93 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  35.66 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4120  formate dehydrogenase accessory protein  34.43 
 
 		 274 aa  161  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3771  formate dehydrogenase accessory protein  34.02 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  35.83 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.6 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4319  formate dehydrogenase accessory protein  32.64 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.917498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4441  formate dehydrogenase accessory protein  35.92 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4430  formate dehydrogenase accessory protein  32.64 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.141571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4159  formate dehydrogenase accessory protein  34.84 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4252  formate dehydrogenase accessory protein  32.64 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4274  formate dehydrogenase accessory protein  32.64 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  36.78 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  36.89 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  36.78 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4365  formate dehydrogenase accessory protein  32.5 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0073  formate dehydrogenase accessory protein  33.47 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  33.07 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  36.16 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3588  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  32.68 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4096  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.8 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2557  formate dehydrogenase accessory protein  37.05 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  33.19 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  38.03 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  33.07 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.62 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  0.14649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  32.28 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0699  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.87 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3657  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.32 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.94 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  35.86 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0201  formate dehydrogenase accessory protein  33.87 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0863  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.87 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0684  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.87 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2334  formate dehydrogenase accessory protein  33.87 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390052  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  36.56 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2414  formate dehydrogenase accessory protein  33.87 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.34 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2744  formate dehydrogenase accessory protein  33.87 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  34.51 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1443  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  32.61 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3924  formate dehydrogenase accessory protein  34.51 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  32.66 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.77 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3460  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.93 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  34.36 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0569  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.81 
 
 		 274 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.25 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4083  formate dehydrogenase accessory protein  35.34 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.2 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0723  formate dehydrogenase accessory protein  34.88 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2685  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.43 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1858  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.75 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3869  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.55 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2355  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.94 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1471  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.01 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0194722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1603  formate dehydrogenase, subunit FdhD  31.14 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.41587  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.03 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.29 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.5 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.663186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4034  formate dehydrogenase, subunit FdhD  33.2 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.15 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0389  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.25 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0838  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.92 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0377992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  33.04 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0188  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.32 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1050  formate dehydrogenase associated protein  36.36 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0737  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.48 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.8 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>