More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0110 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  99.64 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  86.33 
 
 		 278 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  86.69 
 
 		 278 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  86.33 
 
 		 278 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  85.97 
 
 		 278 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  54.02 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0057  formate dehydrogenase accessory protein  54.17 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0073  formate dehydrogenase accessory protein  52.28 
 
 		 277 aa  258  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0036  formate dehydrogenase accessory protein  50 
 
 		 274 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3771  formate dehydrogenase accessory protein  49.6 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4120  formate dehydrogenase accessory protein  49.6 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03780  formate dehydrogenase accessory protein  51.87 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03729  hypothetical protein  51.87 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0082  formate dehydrogenase accessory protein  50.21 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4089  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  51.45 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5346  formate dehydrogenase accessory protein  51.45 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4425  formate dehydrogenase accessory protein  51.45 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4123  formate dehydrogenase accessory protein  51.45 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4122  formate dehydrogenase accessory protein  51.45 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4374  formate dehydrogenase accessory protein  51.45 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4282  formate dehydrogenase accessory protein  51.24 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4441  formate dehydrogenase accessory protein  49.79 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4159  formate dehydrogenase accessory protein  51.04 
 
 		 277 aa  248  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4365  formate dehydrogenase accessory protein  48.11 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4319  formate dehydrogenase accessory protein  47.73 
 
 		 278 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.917498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4430  formate dehydrogenase accessory protein  47.35 
 
 		 278 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.141571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4274  formate dehydrogenase accessory protein  47.35 
 
 		 278 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4252  formate dehydrogenase accessory protein  47.35 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4083  formate dehydrogenase accessory protein  49.18 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  48.84 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.53 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  47.47 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.51 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  44.36 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.15 
 
 		 277 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  42.42 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1125  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.31 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.802085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2747  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.59 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  41.41 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.44 
 
 		 272 aa  191  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2059  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  40.42 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.18 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1423  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.678396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4092  formate dehydrogenase, subunit FdhD  40.15 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.59 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.20274  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6444  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.38 
 
 		 290 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.5 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.8 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.135991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2105  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.8 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2717  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.8 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5686  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  0.185398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1517  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.76 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0766825 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5399  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.73 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286085  normal  0.067336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0389  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.16 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  39.36 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6044  formate dehydrogenase, subunit FdhD  41.95 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2635  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.53 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0699  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  40.41 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6967  formate dehydrogenase, subunit FdhD  40.59 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2769  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.53 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4034  formate dehydrogenase, subunit FdhD  40.48 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.08 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2414  formate dehydrogenase accessory protein  40.41 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0201  formate dehydrogenase accessory protein  40.41 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0863  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.41 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0684  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  40.41 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2334  formate dehydrogenase accessory protein  40.41 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2744  formate dehydrogenase accessory protein  40.41 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0569  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.25 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  38.34 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0257  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.28 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0272  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.28 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0391  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4953  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.56 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211752  hitchhiker  0.000061887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3826  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.13 
 
 		 313 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.145435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4945  formate dehydrogenase, subunit FdhD  39.83 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0723  formate dehydrogenase accessory protein  38.64 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1050  formate dehydrogenase associated protein  39.11 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  39.58 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000093  formate dehydrogenase chain D  40.25 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5406  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  39.74 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3924  formate dehydrogenase accessory protein  39.84 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0282  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.43 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  39.2 
 
 		 274 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.67 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0280  formate dehydrogenase, subunit FdhD  39.5 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.43 
 
 		 299 aa  161  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4388  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.57 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.915911  normal  0.955368 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4278  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.57 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.11 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2355  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.89 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  37.01 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.26 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.663186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  38.59 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68430  putative formate dehydrogenase accessory protein FdhD  40.09 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.270823  normal  0.596134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0748  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.78 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.55 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>