More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4145 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 321 aa  631  1e-180  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1914  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  50.19 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.84446  hitchhiker  0.0000450272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.57 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.24 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.64 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.24 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4073  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.75 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  49.24 
 
 		 274 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  49.24 
 
 		 274 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  47.51 
 
 		 276 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3645  formate dehydrogenase accessory protein  49.24 
 
 		 274 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1325  formate dehydrogenase  50 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.56 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.47 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.01 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  48.86 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  47.24 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.73 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  49.18 
 
 		 251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  47.31 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.57 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  44.49 
 
 		 287 aa  189  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  44.32 
 
 		 278 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  46.18 
 
 		 281 aa  185  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.503102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.04 
 
 		 284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.19 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1335  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.86 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000543766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.91 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1624  formate dehydrogenase accessory protein  45.95 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.42 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.54 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3467  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.56 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.11 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0919  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.15 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0877  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.77 
 
 		 288 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.4 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.32 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.121584  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0802  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.89 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.12 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5379  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  44.75 
 
 		 248 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4473  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  43.4 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.979472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.31 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.58 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.255284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3047  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.96 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2306  formate dehydrogenase accessory protein  44.78 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2123  formate dehydrogenase, subunit FdhD  37.36 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  hitchhiker  0.00982991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0300  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  42.91 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2698  formate dehydrogenase, subunit FdhD  43.37 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0902014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29960  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.93 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0826  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  45.13 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0667  formate dehydrogenase, subunit FdhD  39.71 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.75 
 
 		 282 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2845  formate dehydrogenase, subunit FdhD  34.62 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1537  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.29 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000559479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.34 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190286  normal  0.450468 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1352  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.82 
 
 		 282 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  33.48 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1654  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.82 
 
 		 282 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0839  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.32 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.734645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0690  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.32 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4096  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.16 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4644  formate dehydrogenase accessory protein  37.29 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.59 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  34.89 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.8 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.77 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.69 
 
 		 272 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  34.06 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  34.06 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  34.5 
 
 		 278 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0622  formate dehydrogenase accessory protein  38.34 
 
 		 275 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3088  formate dehydrogenase accessory protein  36.73 
 
 		 278 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  33.91 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  35.78 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  35.78 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  35.78 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  30.48 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  30.83 
 
 		 268 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  35.71 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  30.82 
 
 		 262 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  30.45 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  30.45 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2896  formate dehydrogenase accessory protein  34.21 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0723  formate dehydrogenase accessory protein  33.58 
 
 		 277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  31.23 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  29.39 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0834  formate dehydrogenase subunit FdhD  36.5 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  32.64 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  36.1 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3819  formate dehydrogenase accessory protein  33.19 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  28.79 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  28.79 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  28.79 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  28.79 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  34.55 
 
 		 276 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.91 
 
 		 262 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  28.79 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3516  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.02 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.23 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  34.15 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>