More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0034 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0034  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 267 aa  544  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190286  normal  0.450468 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3516  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.43 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  41.11 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  41.11 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3645  formate dehydrogenase accessory protein  41.11 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4073  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.94 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4033  formate dehydrogenase accessory protein  39.39 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.9 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0406  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.5 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.9 
 
 		 299 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2346  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.34 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  39.84 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1537  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.97 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000559479  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.88 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40.94 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.18 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.81 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.53 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.01 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0802  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.82 
 
 		 309 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  36.23 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.23 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.56 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5379  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  41.27 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.37 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.503102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38.34 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3467  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.92 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  40 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.15 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0667  formate dehydrogenase, subunit FdhD  34.65 
 
 		 320 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  39.42 
 
 		 288 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1914  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  38 
 
 		 285 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.84446  hitchhiker  0.0000450272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4473  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.92 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.979472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3682  formate dehydrogenase subunit FdhD  38.91 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.96 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1335  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.4 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000543766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.94 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0036  formate dehydrogenase accessory protein  33.47 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.36 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0877  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.74 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2123  formate dehydrogenase, subunit FdhD  38.53 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  hitchhiker  0.00982991 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3771  formate dehydrogenase accessory protein  33.47 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0065  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.69 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.255284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0057  formate dehydrogenase accessory protein  33.47 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4120  formate dehydrogenase accessory protein  33.06 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1325  formate dehydrogenase  37.74 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2306  formate dehydrogenase accessory protein  39.77 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.96 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1624  formate dehydrogenase accessory protein  38.37 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199677  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0919  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  37.89 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0300  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.34 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0444  formate dehydrogenase accessory protein  35.78 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2845  formate dehydrogenase, subunit FdhD  34.04 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3047  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.12 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3635  formate dehydrogenase accessory protein  34.33 
 
 		 274 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.72 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.121584  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4159  formate dehydrogenase accessory protein  32.43 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  31.84 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1390  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  33.46 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.780868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4441  formate dehydrogenase accessory protein  33.46 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3924  formate dehydrogenase accessory protein  34.39 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4096  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.09 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0082  formate dehydrogenase accessory protein  32.3 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0826  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.78 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2355  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.1 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0073  formate dehydrogenase accessory protein  31.85 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 282 aa  131  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29960  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.88 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4282  formate dehydrogenase accessory protein  31.85 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715148  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03780  formate dehydrogenase accessory protein  31.98 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4089  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.98 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4123  formate dehydrogenase accessory protein  31.98 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4365  formate dehydrogenase accessory protein  30.04 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5346  formate dehydrogenase accessory protein  31.98 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4122  formate dehydrogenase accessory protein  31.98 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4425  formate dehydrogenase accessory protein  31.98 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03729  hypothetical protein  31.98 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4374  formate dehydrogenase accessory protein  31.98 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0254  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  36.4 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0343903  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2744  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.44 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4252  formate dehydrogenase accessory protein  30.68 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4319  formate dehydrogenase accessory protein  31.02 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.917498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.02 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4430  formate dehydrogenase accessory protein  31.02 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.141571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4274  formate dehydrogenase accessory protein  31.02 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.17 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3020  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.85 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.848082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  31.25 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4083  formate dehydrogenase accessory protein  31.6 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.2 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0994  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.56 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  31.7 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  30.86 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  30.86 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  30.45 
 
 		 278 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.43 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.29 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859238  normal  0.14649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  29.41 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  30.7 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  30.7 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>