More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2277 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 258 aa  531  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.17 
 
 		 468 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.76 
 
 		 487 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.92 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.17 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.16 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.48 
 
 		 468 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.2 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  33.05 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  35.02 
 
 		 483 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  31.89 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  33.9 
 
 		 479 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  34.3 
 
 		 478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.95 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.05 
 
 		 255 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  32.5 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2990  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.03 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68227e-19 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.08 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.76 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2122  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.9 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.545765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1343  formate dehydrogenase accessory protein  30.25 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  31.33 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.66 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  31.33 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  31.33 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  32.19 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  29.63 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  32.64 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2451  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.83 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0979035  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3364  formate dehydrogenase accessory protein  28.22 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.144836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3628  formate dehydrogenase accessory protein  28.22 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1033  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.43 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0364714  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  34.48 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.5 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0280  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.56 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.717981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3595  formate dehydrogenase accessory protein  28.63 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1176  putative fdhD protein  30.99 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.108793 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3328  formate dehydrogenase accessory protein  27.8 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0183588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1386  fdhD protein  31.23 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3678  formate dehydrogenase accessory protein  28.22 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.688402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  28.22 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3585  formate dehydrogenase accessory protein  28.22 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4711  formate dehydrogenase accessory protein  28.28 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3723  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.77 
 
 		 303 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.521477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0501  formate dehydrogenase accessory protein  28.69 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  30.74 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0626  formate dehydrogenase accessory protein  28.28 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  27.78 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.52 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3278  formate dehydrogenase accessory protein  27.8 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2305  formate dehydrogenase accessory protein  27.89 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2347  formate dehydrogenase accessory protein  27.89 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  29.8 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  29.8 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  29.8 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1624  formate dehydrogenase accessory protein  30.37 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.1 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  29.8 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  28.21 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0504  formate dehydrogenase accessory protein  28.1 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  29.8 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3715  formate dehydrogenase subunit FdhD  26.17 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351414  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.89 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.559455 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5485  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.93 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3132  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.65 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0690  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.2 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0839  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.2 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.734645  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.74 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5379  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.92 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3256  formate dehydrogenase, subunit FdhD  29.88 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.340615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2010  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.28 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.068526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.89 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2580  formate dehydrogenase subunit FdhD  28.88 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  0.264505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.71 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.21 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0839  formate dehydrogenase, subunit FdhD  27.34 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.145713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  30.45 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.94 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.51 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1654  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.86 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.33 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1352  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.86 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2855  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.08 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  31.67 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2431  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.91 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0582  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.65 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1914  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.73 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.84446  hitchhiker  0.0000450272 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1126  formate dehydrogenase accessory protein  28.15 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2756  formate dehydrogenase subunit FdhD  27.71 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000145311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4145  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.19 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.69 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2786  formate dehydrogenase subunit FdhD  28.24 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0374953  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2367  FDHD protein  27.66 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0478854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0687  formate dehydrogenase, subunit FdhD  28.63 
 
 		 276 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0877  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.88 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.45 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4143  formate dehydrogenase subunit FdhD  27.8 
 
 		 280 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2176  formate dehydrogenase subunit FdhD  28.09 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60851  normal  0.0520829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>