More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0280 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0280  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.717981  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  32.08 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.948078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1911  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  33.33 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1860  formate dehydrogenase accessory protein  28.84 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1386  fdhD protein  33.2 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1681  formate dehydrogenase accessory protein  30.74 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1500  formate dehydrogenase accessory protein  30.86 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.919736  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0479  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.54 
 
 		 233 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.161878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2277  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.56 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0211  formate dehydrogenase accessory protein  28.25 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0358  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.12 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2817  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.33 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0990  hypothetical protein  32.77 
 
 		 506 aa  105  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1437  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.33 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1030  formate dehydrogenase accessory protein  30.45 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3370  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.99 
 
 		 487 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2076  formate dehydrogenase, subunit FdhD  27.27 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.82479e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00469  formate dehydrogenase accessory protein  31.15 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0547  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.09 
 
 		 237 aa  102  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2130  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.38 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1440  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  25.85 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1248  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.27 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2060  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.57 
 
 		 262 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000863556  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1216  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.67 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.944709  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3385  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.87 
 
 		 483 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1205  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.04 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.495294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0780  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  26.25 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.162723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2876  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.35 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0487293  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0103  formate dehydrogenase accessory protein  26.2 
 
 		 278 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0111  formate dehydrogenase accessory protein  26.88 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1062  formate dehydrogenase, subunit FdhD  26.21 
 
 		 479 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0656292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0719  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.21 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0108  formate dehydrogenase accessory protein  26.55 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0110  formate dehydrogenase accessory protein  26.48 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0106  formate dehydrogenase accessory protein  26.48 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0108  formate dehydrogenase accessory protein  25.83 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2382  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.14 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3534  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.32 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3339  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.67 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3516  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.85 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2306  formate dehydrogenase accessory protein  32.95 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0989  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  25.53 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3577  formate dehydrogenase accessory protein  29.12 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3572  formate dehydrogenase accessory protein  29.12 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3645  formate dehydrogenase accessory protein  29.12 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0758  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.36 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0784  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.36 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2149  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.45 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0639  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.41 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.444789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1840  formate dehydrogenase accessory protein  29.75 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00380429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2264  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.62 
 
 		 468 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2204  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.78 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.154366  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1958  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.62 
 
 		 468 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2175  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  25 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2593  formate dehydrogenase accessory protein  27.97 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0107  formate dehydrogenase accessory protein  25.3 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1624  formate dehydrogenase accessory protein  29.48 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0556  formate dehydrogenase accessory protein  28.74 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152789  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4441  formate dehydrogenase accessory protein  28.11 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  31.45 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3374  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.63 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0620  formate dehydrogenase accessory protein  26.72 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.979772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1335  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.91 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000543766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4114  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.37 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12913  formate dehydrogenase accessory protein  28.02 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0200  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.21 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.754057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12240  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.2 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1293  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  24.89 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000222407  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4115  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.1 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.271618  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0817  formate dehydrogenase accessory protein  27.42 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0766349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0873  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.89 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06930  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.31 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.215671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0877  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.89 
 
 		 288 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4019  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.45 
 
 		 288 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2990  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  23.46 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68227e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1537  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.68 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000559479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0654  formate dehydrogenase accessory protein  25.81 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0556  formate dehydrogenase accessory protein  25.81 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0498  formate dehydrogenase accessory protein  25.81 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0644  formate dehydrogenase accessory protein  25.81 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1320  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  29.48 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0588  formate dehydrogenase accessory protein  25.81 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2747  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.37 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3478  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  25.83 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.739751  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1058  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.02 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0466  formate dehydrogenase accessory protein  26.82 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.276769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3910  formate dehydrogenase accessory protein FdhD, putative  25.68 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0829  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  28.51 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0159111  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1258  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  30.34 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4025  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  23.89 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0500  formate dehydrogenase accessory protein  25.81 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3714  formate dehydrogenase, subunit FdhD  25.29 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.525322 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3785  formate dehydrogenase, subunit FdhD  25.29 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0292467  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0715  formate dehydrogenase accessory protein  26.03 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0035  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.27 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3132  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  26.09 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3157  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.68 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.630603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2665  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  27.23 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3578  formate dehydrogenase accessory protein  23.89 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0806  formate dehydrogenase accessory protein  28.93 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>